More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03865 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  100 
 
 		 433 aa  850    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  53.43 
 
 		 424 aa  472  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  55.34 
 
 		 430 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  55.58 
 
 		 430 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  55.34 
 
 		 430 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  54.61 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  55.29 
 
 		 430 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  55.53 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  55.34 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  54.81 
 
 		 429 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  53.35 
 
 		 427 aa  448  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  50.57 
 
 		 436 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  50.78 
 
 		 454 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  48.59 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  51.06 
 
 		 439 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  52.66 
 
 		 426 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  50.36 
 
 		 429 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  47.13 
 
 		 441 aa  411  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  47.04 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  47.23 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  47.31 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  48.49 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  46.53 
 
 		 431 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  44.58 
 
 		 449 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  45.51 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  45.85 
 
 		 442 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  45.41 
 
 		 439 aa  368  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  43.7 
 
 		 457 aa  366  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  45.37 
 
 		 441 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 445 aa  361  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  43.83 
 
 		 439 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  43.83 
 
 		 442 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  45.89 
 
 		 435 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  43.66 
 
 		 441 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  43.41 
 
 		 480 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 441 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02062  putative transporter transmembrane protein  46.62 
 
 		 441 aa  353  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000104941  normal  0.781434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  42.44 
 
 		 432 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2448  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 409 aa  313  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581947  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  42.41 
 
 		 501 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  40.95 
 
 		 411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2272  major facilitator superfamily MFS_1  37.26 
 
 		 479 aa  303  5.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.972023  decreased coverage  0.00181869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4265  major facilitator transporter  38 
 
 		 489 aa  294  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762522  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 428 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 441 aa  273  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  36.47 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 		 434 aa  259  6e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 420 aa  259  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  36.19 
 
 		 435 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 432 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  30.82 
 
 		 424 aa  233  6e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  33.41 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  33.41 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  34.61 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  35.32 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  33.96 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  33.96 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  33.96 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 425 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1313  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 433 aa  223  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.720769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 436 aa  223  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  33.49 
 
 		 432 aa  222  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  33.81 
 
 		 433 aa  221  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3386  d-galactonate transporter  33.57 
 
 		 434 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  33.72 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0926  putative hexuronate transporter  33.82 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0978  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3361  putative hexuronate transporter  33.82 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  31.66 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  33.72 
 
 		 472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3599  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  33.72 
 
 		 472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1611  major facilitator superfamily MFS_1  34.76 
 
 		 433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.585379  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 436 aa  217  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  31.66 
 
 		 434 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  31.66 
 
 		 434 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  31.66 
 
 		 434 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  31.66 
 
 		 434 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2353  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 436 aa  216  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  33.26 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 435 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 435 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03520  conserved hypothetical protein  33.08 
 
 		 452 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03471  hypothetical protein  33.08 
 
 		 452 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 436 aa  213  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>