238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03712 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
241 aa  497  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  73.08 
 
 
253 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  73.5 
 
 
253 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  80.18 
 
 
237 aa  363  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  61.14 
 
 
231 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  61.14 
 
 
231 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  62.22 
 
 
233 aa  292  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  60.7 
 
 
232 aa  292  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  62.67 
 
 
235 aa  291  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  57.96 
 
 
231 aa  289  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  58.7 
 
 
230 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  59.13 
 
 
230 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  60.18 
 
 
241 aa  286  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  58.7 
 
 
230 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  60.96 
 
 
231 aa  286  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  60.18 
 
 
229 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  57.83 
 
 
230 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  61.33 
 
 
233 aa  284  9e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  64.71 
 
 
218 aa  282  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  59.65 
 
 
229 aa  277  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  59.21 
 
 
243 aa  277  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  56.44 
 
 
230 aa  275  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  58.15 
 
 
261 aa  274  9e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  60 
 
 
226 aa  272  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  64.04 
 
 
228 aa  271  5.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  55.11 
 
 
230 aa  271  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  57.08 
 
 
226 aa  269  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  54.7 
 
 
240 aa  267  8.999999999999999e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  63.45 
 
 
228 aa  267  8.999999999999999e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  63.27 
 
 
228 aa  263  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  58.04 
 
 
229 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  63.27 
 
 
228 aa  263  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  58.21 
 
 
224 aa  261  4.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  56.42 
 
 
223 aa  262  4.999999999999999e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  55.3 
 
 
221 aa  259  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  56.48 
 
 
225 aa  258  7e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  53.15 
 
 
223 aa  257  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  53.74 
 
 
269 aa  256  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  55.25 
 
 
226 aa  256  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  56.19 
 
 
232 aa  255  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  56.48 
 
 
225 aa  254  6e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  57.67 
 
 
227 aa  254  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  58.14 
 
 
228 aa  254  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  58.14 
 
 
228 aa  254  6e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  58.14 
 
 
228 aa  254  9e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  58.1 
 
 
229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  58.1 
 
 
229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  53 
 
 
222 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  58.1 
 
 
229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  58.1 
 
 
229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  58.1 
 
 
229 aa  251  7e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  53.88 
 
 
222 aa  251  7e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  58.1 
 
 
229 aa  251  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  57.62 
 
 
229 aa  250  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  57.62 
 
 
229 aa  250  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  54.5 
 
 
225 aa  249  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  57.62 
 
 
229 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  52.53 
 
 
222 aa  248  6e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  59.2 
 
 
229 aa  248  9e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  54.73 
 
 
222 aa  246  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  53.18 
 
 
224 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  53.64 
 
 
221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 
222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  60.71 
 
 
229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  60.2 
 
 
229 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  60.2 
 
 
229 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  60.2 
 
 
229 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  60.2 
 
 
229 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  54.55 
 
 
222 aa  240  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0246  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 
221 aa  240  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  50.93 
 
 
225 aa  238  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  53 
 
 
219 aa  237  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  51.75 
 
 
232 aa  237  1e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  53.69 
 
 
221 aa  237  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  52.25 
 
 
235 aa  237  1e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  57 
 
 
224 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
223 aa  236  3e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  51.63 
 
 
216 aa  236  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  52.97 
 
 
222 aa  235  4e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  50.45 
 
 
220 aa  235  6e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  51.36 
 
 
221 aa  234  8e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  51.15 
 
 
218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 
221 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  53.12 
 
 
226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  54.3 
 
 
231 aa  232  4.0000000000000004e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2378  uracil-DNA glycosylase  53.95 
 
 
234 aa  231  6e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155716  normal  0.0973542 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
219 aa  231  6e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  52.97 
 
 
221 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
219 aa  231  9e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
247 aa  230  1e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
230 aa  230  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  50.89 
 
 
245 aa  230  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1229  putative uracil-DNA glycosylase  51.85 
 
 
218 aa  230  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  53.92 
 
 
229 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  49.1 
 
 
226 aa  230  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  50.69 
 
 
221 aa  230  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
221 aa  228  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>