29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03540 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03540  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  753    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3161  hypothetical protein  39.48 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2293  hypothetical protein  37.76 
 
 		 395 aa  200  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893787  normal  0.236124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0867  hypothetical protein  32.71 
 
 		 429 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1808  hypothetical protein  35.71 
 
 		 391 aa  189  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0734  hypothetical protein  34.65 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00069101 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2188  hypothetical protein  37.5 
 
 		 401 aa  182  8.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2281  hypothetical protein  37.93 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0844  hypothetical protein  33.33 
 
 		 397 aa  172  9e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1443  hypothetical protein  32.69 
 
 		 391 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0891  hypothetical protein  32.12 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0783  hypothetical protein  33.06 
 
 		 391 aa  166  8e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0052  conserved hypothetical cytosolic protein  37.46 
 
 		 441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1627  hypothetical protein  32.9 
 
 		 394 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0740  hypothetical protein  34.48 
 
 		 395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22920  hypothetical protein  34.87 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0225  hypothetical protein  38.32 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010208 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0515  hypothetical protein  32.78 
 
 		 403 aa  160  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0062  hypothetical protein  31.32 
 
 		 413 aa  159  9e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0014  conserved hypothetical cytosolic protein  34.46 
 
 		 392 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1134  hypothetical protein  33.8 
 
 		 384 aa  137  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1439  hypothetical protein  37.12 
 
 		 145 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0425  hypothetical protein  26.67 
 
 		 394 aa  76.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17250  hypothetical protein  31.65 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03285  hypothetical protein  26.65 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157228  unclonable  1.30992e-21 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0874  hypothetical protein  25.62 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3695  hypothetical protein  28.51 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000243995 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3324  hypothetical protein  44.71 
 
 		 101 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0788  hypothetical protein  44.62 
 
 		 92 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>