52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03539 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  100 
 
 		 1143 aa  2284    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  71.3 
 
 		 1126 aa  1593    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  46.47 
 
 		 1124 aa  891    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  37.85 
 
 		 1137 aa  709    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  34.46 
 
 		 1128 aa  543  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  33.81 
 
 		 1118 aa  495  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1122 aa  474  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  32.58 
 
 		 1125 aa  461  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1125 aa  457  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  31.02 
 
 		 1121 aa  456  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  31.68 
 
 		 1121 aa  459  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1121 aa  451  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1121 aa  451  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  30.95 
 
 		 1121 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1144 aa  444  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  30.26 
 
 		 1143 aa  442  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  31.92 
 
 		 1140 aa  439  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  32.38 
 
 		 1124 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  30.56 
 
 		 1136 aa  436  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  32.65 
 
 		 1133 aa  419  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  31.87 
 
 		 1120 aa  411  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  29.69 
 
 		 1130 aa  399  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  31.07 
 
 		 1123 aa  388  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  29.21 
 
 		 1154 aa  327  7e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  29.09 
 
 		 1153 aa  323  8e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  29.36 
 
 		 1151 aa  309  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1146 aa  309  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  33.38 
 
 		 1166 aa  301  4e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  27.22 
 
 		 1133 aa  300  9e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1120 aa  288  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1118 aa  285  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1114 aa  285  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1120 aa  285  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1120 aa  285  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1126 aa  284  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  29.44 
 
 		 1120 aa  268  5.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1125 aa  254  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1121 aa  248  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1045 aa  215  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  25.6 
 
 		 979 aa  212  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  48.22 
 
 		 352 aa  175  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  26.01 
 
 		 694 aa  161  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1181 aa  131  9.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  26.72 
 
 		 462 aa  89.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  27.35 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  20.72 
 
 		 1113 aa  65.5  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  25.75 
 
 		 1107 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  25.85 
 
 		 1109 aa  52.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  32.46 
 
 		 1207 aa  52.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  23.03 
 
 		 1159 aa  48.9  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  29.36 
 
 		 1138 aa  46.2  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  36.36 
 
 		 1228 aa  45.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>