292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03481 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03481  recombination protein F  100 
 
 		 365 aa  731    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0003  recombination protein F  73.11 
 
 		 364 aa  511  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0003  recombination protein F  58.38 
 
 		 364 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.26612  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0003  recombination protein F  57.54 
 
 		 364 aa  428  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0185053  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0010  recombination protein F  35.69 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0003  recombination protein F  35.69 
 
 		 360 aa  215  9e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.316978  hitchhiker  0.00705664 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0003  recombination protein F  35.52 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0851424  hitchhiker  0.00000000117147 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0003  recombination protein F  35.69 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.029356  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0003  recombination protein F  35.52 
 
 		 360 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0003  recombination protein F  35.52 
 
 		 360 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133569  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0011  recombination protein F  35.42 
 
 		 360 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00668622  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0003  recombination protein F  35.52 
 
 		 360 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0977543  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0003  recombination protein F  34.97 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0003  recombination protein F  35.54 
 
 		 360 aa  207  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0384357  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0008  recombination protein F  34.44 
 
 		 360 aa  205  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0621721  hitchhiker  0.00000000274736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0003  recombination protein F  34.44 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0003  DNA replication and repair protein RecF  37.64 
 
 		 360 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0698954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0003  recombination protein F  33.98 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0188151  hitchhiker  0.0000523089 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0003  recombination protein F  34.44 
 
 		 365 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00186248  hitchhiker  0.000000180359 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0015  recombination protein F  35.36 
 
 		 360 aa  196  7e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00214178  hitchhiker  0.000779425 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0003  recombination protein F  33.98 
 
 		 360 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000366734  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3716  DNA replication and repair protein RecF  32.32 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.362635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0018  RecF protein  35.46 
 
 		 363 aa  192  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0003  recombination protein F  35.31 
 
 		 368 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000843052  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.79 
 
 		 362 aa  189  9e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000176519  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00005  Recombinational DNA repair ATPase  33.04 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000571812  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0011  recombination protein F  32.51 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002007  DNA recombination and repair protein RecF  33.33 
 
 		 359 aa  186  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0003677  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00444  recombination protein F  33.33 
 
 		 357 aa  186  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4175  recombination protein F  34.52 
 
 		 361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0239408  normal  0.0132322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0003  recombination protein F  34.52 
 
 		 361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4151  recombination protein F  34.52 
 
 		 361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000332755  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0003  recombination protein F  36.14 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.87 
 
 		 363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0752559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00030  recombination protein F  35.87 
 
 		 369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00030  recombination protein F  35.79 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0003  recombination protein F  34.75 
 
 		 367 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0003  recombination protein F  34.52 
 
 		 361 aa  179  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0385213  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0003  recombination protein F  33.97 
 
 		 361 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0661286  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0003  recombination protein F  34.75 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.801088  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03583  recombination protein F  33.7 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.517201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.7 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.877523  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0005  recombination protein F  34.58 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0003  recombination protein F  34.58 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3913  recombination protein F  33.7 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00221081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4210  recombination protein F  33.7 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000837842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0034  recombination protein F  34.52 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000927918  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0138  recombination protein F  32.5 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0003  recombination protein F  33.7 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0566679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03527  hypothetical protein  33.7 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0003  recombination protein F  34.15 
 
 		 361 aa  178  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4065  recombination protein F  33.7 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0837895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5128  recombination protein F  33.7 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.010515  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0003  recombination protein F  34.32 
 
 		 367 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113705  normal  0.121048 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2505  recombination protein F  31.58 
 
 		 363 aa  177  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0488541  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.22 
 
 		 367 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0003  recombination protein F  34.15 
 
 		 361 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0110624  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0012  recombination protein F  34.32 
 
 		 367 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4121  recombination protein F  33.15 
 
 		 357 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.976477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4170  recombination protein F  33.15 
 
 		 357 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  normal  0.357156 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4228  recombination protein F  33.15 
 
 		 357 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4064  recombination protein F  33.15 
 
 		 357 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0003  recombination protein F  35.54 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4048  recombination protein F  33.24 
 
 		 357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.35 
 
 		 373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346024  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0003  DNA replication and repair protein RecF  31.93 
 
 		 357 aa  173  5e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167718  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0003  DNA replication and repair protein  31.93 
 
 		 357 aa  172  9e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0109066  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4225  recombination protein F  33.15 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164466  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0003  DNA replication and repair protein RecF  37.15 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180653  normal  0.423581 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0003  recombination protein F  32.59 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000748335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  32.43 
 
 		 370 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1225  DNA replication and repair protein RecF  36.83 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.193168  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0003  RecF protein  32.88 
 
 		 367 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312936  normal  0.12892 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0003  RecF recombinational DNA repair ATPase  31.63 
 
 		 353 aa  166  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0003  recombination protein F  33.68 
 
 		 367 aa  166  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3031  DNA replication and repair protein RecF  35.18 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0003  RecF recombinational DNA repair ATPase  31.63 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.23 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.79 
 
 		 377 aa  157  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.82 
 
 		 357 aa  152  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.795799 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  31.96 
 
 		 368 aa  142  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  30.21 
 
 		 374 aa  139  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0002  DNA replication and repair protein RecF  33.04 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.617644  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.04 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00329262  decreased coverage  0.000397503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  27.1 
 
 		 364 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  28.16 
 
 		 375 aa  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  27.37 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  27.37 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  27.37 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  27.37 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  27.37 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  27.37 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  27.37 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  27.37 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  27.63 
 
 		 375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.61 
 
 		 364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  27.54 
 
 		 373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  26.81 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  27.71 
 
 		 371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  26.22 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>