179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03097 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03097  outer membrane protein  100 
 
 
228 aa  461  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3523  OmpW family protein  65.5 
 
 
211 aa  283  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.11983  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1909  OmpW family protein  48.95 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000171006  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1977  outer membrane protein  48.52 
 
 
218 aa  194  8.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.000000000000671005  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  32.02 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  28.02 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  33.33 
 
 
211 aa  91.7  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  33.33 
 
 
211 aa  91.7  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  30.17 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  31.03 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  32.73 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  32.8 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  36.18 
 
 
210 aa  88.6  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  32.26 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  29.45 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  30.46 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  31.79 
 
 
214 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  30.97 
 
 
215 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  30.97 
 
 
215 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  31.79 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  30.97 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  30.22 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1326  OmpW family outer membrane protein  31.38 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0285584  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  30.51 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  34.34 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1052  OmpW  30.46 
 
 
211 aa  79  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  31.65 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.591363 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  28.63 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  28.63 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  28.63 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  28.63 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  28.63 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  31.29 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  31.71 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  31.9 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  27.54 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  31.9 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  31.9 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  31.01 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  30.06 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  31.48 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  31.9 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  31.9 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  30.54 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  30.67 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  28.19 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  29.09 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  30.67 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  30.67 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  31.52 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  26.42 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  28.39 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  33.33 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  26.67 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  31.21 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  28.92 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  33.57 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  33.57 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  28.39 
 
 
215 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  29.14 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  26.99 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  27.81 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  29.14 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  29.05 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  26.77 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  33.33 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  29.45 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  28.96 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  25 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  29.17 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  32.32 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  31.29 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  30.43 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  28.14 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  32.69 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  28.14 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  32.69 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3286  OmpW family protein  30.05 
 
 
224 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  27.22 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  27.22 
 
 
224 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  29.3 
 
 
214 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  29.3 
 
 
214 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  29.3 
 
 
214 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  29.3 
 
 
214 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  29.3 
 
 
214 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  29.56 
 
 
216 aa  62  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  29.3 
 
 
194 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  29.56 
 
 
214 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  29.3 
 
 
194 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  28.93 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  28.93 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  28.93 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  27.27 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  28.93 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  28.93 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  28.93 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  31.13 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  29.28 
 
 
200 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  30.18 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  30.07 
 
 
198 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>