More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03048 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03048  uracil DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 
477 aa  963    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2002  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.39 
 
 
495 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.515023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2983  putative Uracil-DNA glycosylase  48.23 
 
 
496 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229765  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1899  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.95 
 
 
480 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.530135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2039  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.99 
 
 
476 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3539  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.18 
 
 
493 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2232  putative uracil-DNA glycosylase  46.85 
 
 
474 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.65 
 
 
484 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547002  normal  0.081946 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0908  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.76 
 
 
485 aa  358  9e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2713  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.82 
 
 
484 aa  358  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7466  hypothetical protein  45.47 
 
 
492 aa  351  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6621  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.46 
 
 
493 aa  350  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647751  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2581  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.16 
 
 
485 aa  348  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148154  normal  0.520534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2306  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.95 
 
 
485 aa  347  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0113153 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4607  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.89 
 
 
479 aa  345  7e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2263  Uracil-DNA glycosylase superfamily  47.36 
 
 
485 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.14 
 
 
485 aa  339  5e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102912  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.49 
 
 
476 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562292  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2068  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.52 
 
 
465 aa  328  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.803704  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1310  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.87 
 
 
490 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.17 
 
 
491 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.716146 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3194  Uracil-DNA glycosylase superfamily  36.32 
 
 
428 aa  223  8e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4407  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3354  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.11 
 
 
217 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.995704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2572  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.26 
 
 
260 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  0.578981 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1758  uracil-DNA glycosylase  41.69 
 
 
299 aa  206  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1286  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.25 
 
 
209 aa  205  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3335  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.85 
 
 
211 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0920628 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5910  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.02 
 
 
220 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2690  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.5 
 
 
224 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2785  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.38 
 
 
224 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.73 
 
 
225 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237053  normal  0.0854342 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01932  putative DNA polymerase related protein  39.43 
 
 
265 aa  196  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2840  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.79 
 
 
206 aa  196  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182688  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4407  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.38 
 
 
213 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.380012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4595  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.48 
 
 
300 aa  194  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4052  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.58 
 
 
202 aa  193  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.833859  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.75 
 
 
213 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.669863  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1521  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.93 
 
 
229 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1481  putative phage DNA polymerase  52.38 
 
 
235 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.13 
 
 
213 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3585  putative DNA polymerase related protein  38.4 
 
 
264 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3008  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.77 
 
 
229 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3202  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.25 
 
 
217 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.961371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2993  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.3 
 
 
230 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3037  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.3 
 
 
230 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541371  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12930  uracil-DNA glycosylase, family 4  52.08 
 
 
211 aa  183  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0522  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.94 
 
 
208 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078684 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2808  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.48 
 
 
237 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1181  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.69 
 
 
224 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2228  hypothetical protein  31.11 
 
 
507 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.93 
 
 
247 aa  178  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.166552  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5631  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.26 
 
 
217 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609757  normal  0.0369434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0834  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.32 
 
 
223 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597478  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.41 
 
 
217 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.500254 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4300  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.19 
 
 
207 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6057  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.14 
 
 
223 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1364  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.14 
 
 
223 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6465  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.14 
 
 
223 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114604  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4396  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.73 
 
 
207 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.53 
 
 
216 aa  169  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3015  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
218 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3144  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
218 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0404  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.56 
 
 
214 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112864  normal  0.964796 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1364  putative DNA glycosylase  50 
 
 
218 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.77623  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5408  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.86 
 
 
244 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.937407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3623  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.91 
 
 
216 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0118  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.26 
 
 
217 aa  164  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5462  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.3 
 
 
219 aa  162  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414402 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5994  Uracil-DNA glycosylase superfamily  37.13 
 
 
546 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.263417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8784  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.02 
 
 
222 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4850  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.6 
 
 
279 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0473991  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4147  hypothetical protein  38.11 
 
 
295 aa  143  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2853  hypothetical protein  36.29 
 
 
282 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889205  normal  0.120479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2624  hypothetical protein  35.89 
 
 
279 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2364  hypothetical protein  36.29 
 
 
279 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.09488  normal  0.230532 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0113  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.31 
 
 
206 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3468  hypothetical protein  35.97 
 
 
279 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2769  hypothetical protein  34.29 
 
 
280 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230469  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2923  hypothetical protein  35.08 
 
 
285 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301224  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0503  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.79 
 
 
216 aa  127  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2122  hypothetical protein  35.86 
 
 
278 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0384708  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.04 
 
 
186 aa  126  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1487  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.03 
 
 
245 aa  124  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.47 
 
 
201 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.12 
 
 
210 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3864  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.49 
 
 
327 aa  117  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0209903 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  36.63 
 
 
210 aa  117  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1058  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.54 
 
 
276 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.35 
 
 
295 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.35 
 
 
205 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1838  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.2 
 
 
185 aa  114  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.35 
 
 
245 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.72 
 
 
199 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.46 
 
 
205 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  33.96 
 
 
224 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.97 
 
 
249 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0266  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.55 
 
 
315 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.87 
 
 
209 aa  110  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.48 
 
 
300 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.21 
 
 
255 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>