43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02998 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02998  transcriptional regulator PbsX family  100 
 
 		 125 aa  247  4e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0860  XRE family transcriptional regulator  64.52 
 
 		 126 aa  157  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0978  XRE family transcriptional regulator  64.52 
 
 		 126 aa  157  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  40 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  44.93 
 
 		 459 aa  53.9  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  37.66 
 
 		 235 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 380 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  35.8 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  31.4 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  41.79 
 
 		 240 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  30.59 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  41.79 
 
 		 240 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  38.46 
 
 		 263 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2653  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  42.62 
 
 		 216 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  42.62 
 
 		 216 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  38.24 
 
 		 222 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 334 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  40.98 
 
 		 216 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  34.09 
 
 		 216 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  37.5 
 
 		 229 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  37.5 
 
 		 229 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  33.33 
 
 		 233 aa  42  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  36.51 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  33.33 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  38.1 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 135 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  36 
 
 		 328 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  33.8 
 
 		 135 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  35.94 
 
 		 217 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  33.33 
 
 		 233 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  42.62 
 
 		 394 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  33.8 
 
 		 293 aa  40.4  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  35.94 
 
 		 229 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 247 aa  40  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1067  transcriptional regulator, XRE family  28.05 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0145003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>