22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02923 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02923  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  335  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  30.15 
 
 
149 aa  85.1  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  38.76 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  80.5  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  34.09 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  36.22 
 
 
149 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  35.38 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  34.11 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  35.56 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  27.34 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  31.06 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  34.43 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  31.78 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  37.5 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  34.35 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  33.61 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  32.31 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  34.09 
 
 
150 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  30.23 
 
 
152 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  36 
 
 
150 aa  58.9  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 
163 aa  45.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05745  hypothetical protein  55.56 
 
 
68 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.948839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>