More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02825 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  100 
 
 		 710 aa  1447    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  76.18 
 
 		 700 aa  1115    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.56 
 
 		 708 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.91 
 
 		 711 aa  398  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.92 
 
 		 690 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.02 
 
 		 690 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.78 
 
 		 690 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.88 
 
 		 690 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.16 
 
 		 690 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.9 
 
 		 707 aa  388  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.15 
 
 		 721 aa  389  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.78 
 
 		 691 aa  388  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.23 
 
 		 691 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.08 
 
 		 690 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.22 
 
 		 690 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.22 
 
 		 690 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.22 
 
 		 690 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.43 
 
 		 690 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.12 
 
 		 714 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.83 
 
 		 720 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.19 
 
 		 690 aa  379  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1427  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.98 
 
 		 714 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.26 
 
 		 692 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  34.2 
 
 		 714 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.34 
 
 		 714 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.81 
 
 		 714 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.56 
 
 		 703 aa  369  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107544  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.67 
 
 		 714 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.85 
 
 		 714 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.43 
 
 		 714 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.87 
 
 		 692 aa  369  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.88 
 
 		 714 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.29 
 
 		 714 aa  366  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.8 
 
 		 691 aa  365  1e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.29 
 
 		 714 aa  366  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.99 
 
 		 694 aa  365  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.24 
 
 		 691 aa  364  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  32.69 
 
 		 691 aa  360  4e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.63 
 
 		 686 aa  359  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.77 
 
 		 712 aa  350  4e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.6 
 
 		 725 aa  347  5e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0014  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.01 
 
 		 729 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4158  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.87 
 
 		 758 aa  327  5e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.8 
 
 		 692 aa  318  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0857  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.24 
 
 		 714 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0969  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.24 
 
 		 714 aa  315  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0884  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.24 
 
 		 714 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.24 
 
 		 714 aa  314  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0866  ATP-dependent DNA helicase DinG  33 
 
 		 716 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0916  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.1 
 
 		 714 aa  313  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2033  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.92 
 
 		 716 aa  312  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1461  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.92 
 
 		 732 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.498771 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00766  ATP-dependent DNA helicase  32.86 
 
 		 716 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2843  helicase c2  32.86 
 
 		 716 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00783  hypothetical protein  32.86 
 
 		 716 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0823  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.86 
 
 		 716 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.86 
 
 		 762 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2844  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.72 
 
 		 716 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0506897 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0853  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.72 
 
 		 716 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1289  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.19 
 
 		 725 aa  308  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0013  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.9 
 
 		 741 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2553  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.58 
 
 		 716 aa  306  9.000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1321  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.55 
 
 		 726 aa  305  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2856  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.55 
 
 		 726 aa  305  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.642331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2777  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.55 
 
 		 726 aa  305  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2495  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.17 
 
 		 701 aa  303  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0503  helicase c2  31.72 
 
 		 750 aa  301  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2910  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.05 
 
 		 699 aa  301  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1552  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.84 
 
 		 699 aa  300  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2732  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.76 
 
 		 738 aa  300  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196414  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2398  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.07 
 
 		 715 aa  297  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.927767  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3670  helicase c2  31.67 
 
 		 664 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.978483  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  32.64 
 
 		 664 aa  247  6e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  31.72 
 
 		 639 aa  246  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  31.66 
 
 		 661 aa  239  1e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  31.09 
 
 		 646 aa  233  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  30.26 
 
 		 658 aa  229  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  31.35 
 
 		 643 aa  229  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  28.44 
 
 		 707 aa  229  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  28.61 
 
 		 838 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  30.5 
 
 		 644 aa  228  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  30.35 
 
 		 668 aa  227  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  28.27 
 
 		 664 aa  227  7e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  30.83 
 
 		 660 aa  224  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  28.84 
 
 		 674 aa  224  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  29.52 
 
 		 647 aa  223  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  30.06 
 
 		 636 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  30.06 
 
 		 636 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  30.06 
 
 		 636 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  30.06 
 
 		 636 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  29.14 
 
 		 843 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  29.22 
 
 		 646 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  30.06 
 
 		 636 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  30.06 
 
 		 636 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.93 
 
 		 952 aa  221  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  29.91 
 
 		 636 aa  221  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  30.43 
 
 		 646 aa  221  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  29.91 
 
 		 636 aa  219  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  27.94 
 
 		 669 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  29.77 
 
 		 636 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>