188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02798 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  100 
 
 
533 aa  1085    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  64.5 
 
 
508 aa  636    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  62.29 
 
 
513 aa  600  1e-170  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  61.91 
 
 
511 aa  600  1e-170  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  38.32 
 
 
507 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  35.31 
 
 
535 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  35.31 
 
 
535 aa  247  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  35.54 
 
 
539 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  35.55 
 
 
539 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  40.05 
 
 
502 aa  240  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  35.31 
 
 
519 aa  236  9e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  33.72 
 
 
538 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  33.72 
 
 
545 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  33.72 
 
 
540 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  33.33 
 
 
532 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  33.49 
 
 
549 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  33.18 
 
 
546 aa  225  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  35.01 
 
 
527 aa  225  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  34.93 
 
 
517 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  34.1 
 
 
533 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  32.08 
 
 
480 aa  215  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  32.24 
 
 
521 aa  208  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  30.26 
 
 
669 aa  164  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  30.36 
 
 
670 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  28.7 
 
 
688 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  28.05 
 
 
693 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 
675 aa  127  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  26.52 
 
 
485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
503 aa  118  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  27.41 
 
 
515 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  26.69 
 
 
680 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  27.81 
 
 
668 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  26.13 
 
 
475 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  25.27 
 
 
522 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  28.97 
 
 
612 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
645 aa  104  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  23.74 
 
 
480 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  28.01 
 
 
514 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  24.54 
 
 
499 aa  101  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  27.02 
 
 
515 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  32.54 
 
 
740 aa  100  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  26.33 
 
 
511 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  26.33 
 
 
511 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  26.33 
 
 
511 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  25.47 
 
 
476 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  25.57 
 
 
495 aa  99.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  26.57 
 
 
506 aa  97.8  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2436  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 
484 aa  96.7  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425173  normal  0.0661487 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  27.18 
 
 
524 aa  95.1  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  26.85 
 
 
499 aa  94.7  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  27.08 
 
 
564 aa  94  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  24.73 
 
 
507 aa  93.6  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  27.16 
 
 
516 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  26.23 
 
 
656 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  25.74 
 
 
521 aa  92  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  26.16 
 
 
521 aa  91.3  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  26.27 
 
 
495 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  27.35 
 
 
508 aa  90.9  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  22.42 
 
 
477 aa  90.5  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  27.23 
 
 
521 aa  87  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  25.15 
 
 
489 aa  86.7  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  25.9 
 
 
485 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  26.83 
 
 
520 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
505 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  25 
 
 
525 aa  84.3  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  26.54 
 
 
538 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  25.75 
 
 
517 aa  82  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  27.66 
 
 
571 aa  81.3  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  28.51 
 
 
533 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  28.51 
 
 
508 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  28.51 
 
 
508 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  22.29 
 
 
504 aa  80.9  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  26.98 
 
 
505 aa  80.1  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  27.47 
 
 
532 aa  80.1  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  28.04 
 
 
535 aa  80.1  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  23.59 
 
 
500 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  25.31 
 
 
537 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  31.54 
 
 
300 aa  77  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  25.81 
 
 
540 aa  76.6  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  26.47 
 
 
494 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  23.75 
 
 
532 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  24.77 
 
 
625 aa  76.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0548452  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  31.44 
 
 
527 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  23.52 
 
 
547 aa  75.5  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  24.5 
 
 
546 aa  75.5  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  31.08 
 
 
505 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  29.18 
 
 
508 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  25 
 
 
504 aa  74.7  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  27.21 
 
 
475 aa  74.3  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  25.42 
 
 
522 aa  73.6  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  28.74 
 
 
515 aa  73.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  29.8 
 
 
750 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  24.95 
 
 
535 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  22.32 
 
 
518 aa  72.4  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1192  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 
490 aa  71.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  32.98 
 
 
505 aa  72  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  23.48 
 
 
545 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  27.19 
 
 
518 aa  71.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  24.95 
 
 
493 aa  71.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  24.85 
 
 
530 aa  70.5  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>