119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02753 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02753  membrane protein YebN  100 
 
 		 232 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3977  protein of unknown function DUF204  72.63 
 
 		 191 aa  252  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.765114  normal  0.164698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4397  hypothetical protein  58.62 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2698  hypothetical protein  60.42 
 
 		 188 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3755  hypothetical protein  56.99 
 
 		 190 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26450  hypothetical protein  58.03 
 
 		 189 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0067592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1725  hypothetical protein  59.67 
 
 		 178 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.113656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6717  protein of unknown function DUF204  55.26 
 
 		 189 aa  210  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2817  hypothetical protein  52.88 
 
 		 189 aa  194  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000019593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1979  protein of unknown function DUF204  53.68 
 
 		 190 aa  192  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0850567  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1922  hypothetical protein  51.3 
 
 		 190 aa  191  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0107711  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2025  protein of unknown function DUF204  50.52 
 
 		 190 aa  188  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.331767  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2215  protein of unknown function DUF204  51.31 
 
 		 190 aa  186  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000652284  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01791  conserved inner membrane protein  51.58 
 
 		 188 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000275472  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1822  protein of unknown function DUF204  51.58 
 
 		 188 aa  185  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1911  hypothetical protein  51.58 
 
 		 188 aa  185  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166044  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2050  hypothetical protein  51.58 
 
 		 188 aa  185  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1811  hypothetical protein  51.58 
 
 		 188 aa  185  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035153  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1366  hypothetical protein  51.58 
 
 		 188 aa  185  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000222622  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2088  hypothetical protein  51.58 
 
 		 188 aa  185  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111578  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2553  hypothetical protein  51.58 
 
 		 188 aa  185  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000161529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01779  hypothetical protein  51.58 
 
 		 188 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1452  hypothetical protein  62.63 
 
 		 194 aa  185  6e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.960759  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1974  membrane protein YebN  53.51 
 
 		 188 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  0.466937 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2035  membrane protein YebN  53.51 
 
 		 188 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1978  membrane protein YebN  53.51 
 
 		 188 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1297  membrane protein YebN  53.51 
 
 		 188 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00128571  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1481  membrane protein YebN  53.51 
 
 		 188 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1382  hypothetical protein  61.05 
 
 		 194 aa  182  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.321925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7389  hypothetical protein  51.04 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0169  hypothetical protein  52.11 
 
 		 196 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0582561  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4096  hypothetical protein  47.92 
 
 		 188 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2390  hypothetical protein  51.26 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2372  hypothetical protein  52.72 
 
 		 189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000118461  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1655  hypothetical protein  52.72 
 
 		 189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000365012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2468  hypothetical protein  52.72 
 
 		 189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00922383  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02440  predicted membrane protein  41.36 
 
 		 188 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1363  hypothetical protein  52.58 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1420  hypothetical protein  39.27 
 
 		 198 aa  138  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000356412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2300  protein of unknown function DUF204  40.84 
 
 		 186 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168239  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0282  hypothetical protein  45.08 
 
 		 193 aa  132  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0273862  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0516  hypothetical protein  40.38 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0503  hypothetical protein  39.81 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1699  protein of unknown function DUF204  41.24 
 
 		 193 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.853895  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2187  protein of unknown function DUF204  33.68 
 
 		 189 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480429 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2039  hypothetical protein  41.58 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1637  hypothetical protein  36.65 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000104558  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3406  protein of unknown function DUF204  40.62 
 
 		 190 aa  121  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000037692  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1799  protein of unknown function DUF204  40.53 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.971603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0455  hypothetical protein  36.13 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.703448 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4533  hypothetical protein  41.45 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0109117 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0162  hypothetical protein  36.32 
 
 		 187 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0202  hypothetical protein  36.32 
 
 		 187 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2102  protein of unknown function DUF204  39.79 
 
 		 187 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0412  hypothetical protein  35.45 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1700  protein of unknown function DUF204  41.05 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000050274  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0180  hypothetical protein  35.79 
 
 		 187 aa  112  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1192  hypothetical protein  36.26 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2453  protein of unknown function DUF204  32.63 
 
 		 187 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3656  protein of unknown function DUF204  32.63 
 
 		 187 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00251893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2522  protein of unknown function DUF204  39.68 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0555852 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2322  protein of unknown function DUF204  38.22 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1273  protein of unknown function DUF204  36.51 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0168  hypothetical protein  34.76 
 
 		 192 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0559  protein of unknown function DUF204  37.16 
 
 		 179 aa  106  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.179338  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1725  membrane protein  30.65 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1412  protein of unknown function DUF204  35.26 
 
 		 189 aa  105  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000313106  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_952  hypothetical protein  36.51 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02600  predicted membrane protein  35.6 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000087208  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0247  hypothetical protein  36.84 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1134  hypothetical protein  35.45 
 
 		 193 aa  101  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000076644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0963  hypothetical protein  35.98 
 
 		 193 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044765  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2978  hypothetical protein  38.24 
 
 		 190 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0770545  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1531  hypothetical protein  33.51 
 
 		 189 aa  99.4  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000880885  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1800  cell division protein  31.72 
 
 		 185 aa  99  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.145109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2070  hypothetical protein  33.72 
 
 		 188 aa  98.6  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000608383  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1232  protein of unknown function DUF204  34.05 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0811336 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1654  membrane protein  31.02 
 
 		 182 aa  95.9  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21610  predicted membrane protein  35.14 
 
 		 188 aa  95.9  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.890881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03700  predicted membrane protein  34.43 
 
 		 185 aa  95.1  9e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0724834  normal  0.0195872 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0607  hypothetical protein  36.84 
 
 		 185 aa  94  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.686733 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0090  membrane protein  34.04 
 
 		 184 aa  93.2  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0210402  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1449  protein of unknown function DUF204  34.05 
 
 		 189 aa  90.5  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.290539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0431  hypothetical protein  32.8 
 
 		 182 aa  89.4  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1107  protein of unknown function DUF204  30.11 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3146  hypothetical protein  32.96 
 
 		 181 aa  85.9  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.120632  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0221  hypothetical protein  30.43 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0006  hypothetical protein  30 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000857448  hitchhiker  0.000000941545 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0024  protein of unknown function DUF204  29.56 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.992365 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4106  hypothetical protein  50.57 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67969  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0005  hypothetical protein  32.09 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.33307  hitchhiker  0.000135585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3288  hypothetical protein  32.95 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00723105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1326  hypothetical protein  31.41 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767112 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1339  hypothetical protein  34 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0007  hypothetical protein  30.73 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  hitchhiker  0.00984847 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4180  protein of unknown function DUF204  33.85 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000492866  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5008  integral membrane protein  29.12 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0149055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5447  hypothetical protein  29.12 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00491428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5505  hypothetical protein  30.05 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000039704  unclonable  3.9395e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5451  hypothetical protein  28.57 
 
 		 182 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>