86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02749 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  50.32 
 
 
802 aa  851    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  100 
 
 
801 aa  1646    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  60.64 
 
 
788 aa  1043    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  25.67 
 
 
786 aa  256  9e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  26.51 
 
 
849 aa  231  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  24.7 
 
 
784 aa  229  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  24.93 
 
 
802 aa  227  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  23.84 
 
 
797 aa  224  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  23.96 
 
 
802 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  23.78 
 
 
762 aa  216  9e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  24.54 
 
 
829 aa  216  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  24.45 
 
 
790 aa  213  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  27.65 
 
 
2859 aa  211  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  25.65 
 
 
785 aa  205  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  25.42 
 
 
801 aa  204  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  25.24 
 
 
797 aa  204  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  24.3 
 
 
2887 aa  203  9e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  26.95 
 
 
2839 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  27.26 
 
 
2839 aa  202  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  27.38 
 
 
2864 aa  201  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  28.45 
 
 
2875 aa  201  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  27.18 
 
 
2864 aa  200  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  25.99 
 
 
2922 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  24.97 
 
 
815 aa  198  4.0000000000000005e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  24.38 
 
 
784 aa  196  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  25.44 
 
 
2880 aa  195  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  26.9 
 
 
2833 aa  195  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  28.3 
 
 
2901 aa  195  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  29.21 
 
 
2831 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  22.69 
 
 
809 aa  193  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  28.59 
 
 
2761 aa  193  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  25.57 
 
 
2732 aa  192  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  23.87 
 
 
794 aa  191  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  29.08 
 
 
2868 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  27.29 
 
 
2845 aa  191  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  24.67 
 
 
2860 aa  191  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  26.12 
 
 
2888 aa  191  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  25.2 
 
 
2864 aa  190  9e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  27.34 
 
 
2932 aa  190  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  24.57 
 
 
1303 aa  189  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  28.06 
 
 
2769 aa  188  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  23.61 
 
 
813 aa  187  5e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  23.61 
 
 
813 aa  187  5e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  28.26 
 
 
2881 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  26.9 
 
 
2916 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  24.28 
 
 
815 aa  185  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.73 
 
 
2868 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  27.52 
 
 
2748 aa  184  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  31.49 
 
 
2779 aa  183  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  27.95 
 
 
2748 aa  182  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  28.51 
 
 
2874 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  23.38 
 
 
824 aa  180  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.41 
 
 
2793 aa  180  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  25.61 
 
 
2870 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  23.79 
 
 
822 aa  179  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  24.63 
 
 
823 aa  178  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  26.12 
 
 
2905 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  27.63 
 
 
2758 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  25.95 
 
 
2929 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  27.55 
 
 
2747 aa  174  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  24.32 
 
 
2786 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  26.16 
 
 
3021 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  25.93 
 
 
2842 aa  169  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  24.76 
 
 
2884 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  28.82 
 
 
624 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  26.91 
 
 
2716 aa  167  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  21.57 
 
 
819 aa  165  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  27.08 
 
 
2730 aa  163  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  22.13 
 
 
811 aa  162  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  23.22 
 
 
811 aa  161  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  21.55 
 
 
797 aa  160  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  29.3 
 
 
2731 aa  160  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  23.58 
 
 
2823 aa  160  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  22.06 
 
 
811 aa  158  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  23.6 
 
 
822 aa  151  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  22.02 
 
 
796 aa  150  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  21.01 
 
 
811 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  21.75 
 
 
831 aa  148  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  21.18 
 
 
811 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  23.54 
 
 
827 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  20.47 
 
 
984 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  27.69 
 
 
900 aa  62.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  23.56 
 
 
1145 aa  50.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  27.22 
 
 
1094 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  28.99 
 
 
1100 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.48 
 
 
759 aa  45.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>