23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02732 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02732  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  186  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  40.68 
 
 
149 aa  60.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  42.7 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  32 
 
 
153 aa  57.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  38.67 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  38.67 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  38.67 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  38.67 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  37.33 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  43.33 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  38.67 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  40.62 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  38.67 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  34.67 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  37.33 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  38.67 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  36.84 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  37.33 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 
163 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  36.49 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>