More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02523 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  100 
 
 
365 aa  744    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  85.56 
 
 
362 aa  626  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  70.87 
 
 
375 aa  530  1e-149  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  70.87 
 
 
375 aa  529  1e-149  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  35.1 
 
 
415 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  37.46 
 
 
350 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  37.46 
 
 
350 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  31.02 
 
 
348 aa  146  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  52.63 
 
 
375 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  36.14 
 
 
351 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  33.42 
 
 
345 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  33.33 
 
 
344 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  32.43 
 
 
344 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  49.32 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  35.16 
 
 
388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  45.03 
 
 
319 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  44.37 
 
 
671 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  29.43 
 
 
345 aa  125  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  31.9 
 
 
344 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  31.9 
 
 
344 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  31.9 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  49.57 
 
 
594 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  31.73 
 
 
344 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  33.2 
 
 
337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  43.93 
 
 
429 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  45.59 
 
 
679 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  43.8 
 
 
586 aa  115  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  43.21 
 
 
447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  32.67 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  29.78 
 
 
401 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  29.77 
 
 
403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  38.38 
 
 
266 aa  113  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  29.01 
 
 
335 aa  113  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  33.86 
 
 
337 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  41.25 
 
 
478 aa  112  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  42.14 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  38.27 
 
 
427 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  31.54 
 
 
394 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  39.17 
 
 
506 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  27.39 
 
 
381 aa  106  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  26.59 
 
 
417 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  40.31 
 
 
402 aa  106  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  40.35 
 
 
244 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  40.12 
 
 
490 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  40.12 
 
 
294 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 
179 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  47.46 
 
 
233 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  38.64 
 
 
420 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.88 
 
 
240 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 
510 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  39.16 
 
 
445 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  39.07 
 
 
428 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 
440 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0727  OmpA/MotB domain protein  48.15 
 
 
178 aa  100  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  45.22 
 
 
620 aa  100  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  42.97 
 
 
640 aa  99.8  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  38.65 
 
 
374 aa  99.8  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  45.61 
 
 
463 aa  99.8  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  39.47 
 
 
231 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
445 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  49.07 
 
 
200 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  28.19 
 
 
468 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  26.43 
 
 
380 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
230 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 
230 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
230 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  41.73 
 
 
641 aa  96.7  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  43.64 
 
 
226 aa  96.7  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0626  OmpA/MotB domain protein  43.51 
 
 
366 aa  96.7  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153451  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  29.1 
 
 
367 aa  96.3  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  29.83 
 
 
328 aa  96.7  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.71 
 
 
623 aa  96.3  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.9 
 
 
407 aa  96.3  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  45.61 
 
 
757 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  45.05 
 
 
230 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  41.44 
 
 
464 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  40.25 
 
 
166 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  38.71 
 
 
322 aa  94  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  46.61 
 
 
241 aa  94.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 
264 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  34.55 
 
 
440 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  45.53 
 
 
344 aa  94  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  26.35 
 
 
363 aa  93.6  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  45.54 
 
 
217 aa  93.2  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  42.37 
 
 
223 aa  93.2  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  45.87 
 
 
238 aa  93.2  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  34.87 
 
 
230 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  38.69 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  48.25 
 
 
345 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  46.02 
 
 
321 aa  92  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
210 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  38.06 
 
 
456 aa  92.4  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02680  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein  45.37 
 
 
430 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181066  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 
645 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  39.39 
 
 
509 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  41.38 
 
 
694 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  44.74 
 
 
321 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  31.12 
 
 
537 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  39.17 
 
 
252 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 
650 aa  90.9  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>