More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02467 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  100 
 
 
234 aa  475  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  83.76 
 
 
234 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1295  protein serine/threonine phosphatase  68.8 
 
 
240 aa  324  8.000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1360  protein phosphatase  68.38 
 
 
240 aa  323  2e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  47.19 
 
 
264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  44.35 
 
 
236 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  43.51 
 
 
425 aa  159  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.35 
 
 
237 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  41.18 
 
 
238 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  40.68 
 
 
241 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  39.74 
 
 
394 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  41.03 
 
 
395 aa  153  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20950  serine/threonine protein phosphatase, 2C-like protein  44.74 
 
 
293 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0398622  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3183  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.86 
 
 
274 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.07989  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  37.18 
 
 
255 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  37.55 
 
 
243 aa  149  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  39.91 
 
 
242 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  43.36 
 
 
416 aa  148  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  36.99 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.68 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  39.41 
 
 
259 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  39.41 
 
 
259 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  41.49 
 
 
452 aa  146  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0146  putative phosphoprotein phosphatase  39.06 
 
 
242 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.26 
 
 
239 aa  143  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  38.53 
 
 
256 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  37.3 
 
 
276 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.59 
 
 
247 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  42.8 
 
 
256 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  40.08 
 
 
240 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  39.26 
 
 
276 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  35.08 
 
 
245 aa  142  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  42.19 
 
 
422 aa  141  7e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  38.28 
 
 
386 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  40.59 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0733  serine/threonine phosphatase  42.11 
 
 
264 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.310547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  38.13 
 
 
548 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  39.75 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  40.52 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  38.1 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  40.34 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0770  protein serine/threonine phosphatase  41.7 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  38.08 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  40.66 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  39.15 
 
 
597 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  45.8 
 
 
252 aa  138  6e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  39.32 
 
 
242 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  39.92 
 
 
270 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  40.95 
 
 
256 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  38.63 
 
 
246 aa  137  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  39.32 
 
 
242 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  39.52 
 
 
269 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0770  protein serine/threonine phosphatase  41.3 
 
 
280 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  40.6 
 
 
320 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  35.77 
 
 
417 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  34.66 
 
 
254 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  42.79 
 
 
248 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  38.87 
 
 
256 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  36.9 
 
 
257 aa  135  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  40.08 
 
 
574 aa  135  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  36.29 
 
 
505 aa  135  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  37.7 
 
 
242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  32.92 
 
 
250 aa  135  7.000000000000001e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3469  protein serine/threonine phosphatase  42.06 
 
 
421 aa  135  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171174  normal  0.272032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39 
 
 
611 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  39.51 
 
 
463 aa  134  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  38.52 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  39.75 
 
 
323 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  38.06 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  34.94 
 
 
419 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  40.17 
 
 
469 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.98 
 
 
238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  38.82 
 
 
265 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  37.65 
 
 
267 aa  132  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  38.4 
 
 
466 aa  132  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  32.38 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  36.4 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.84 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  31.65 
 
 
245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  38.98 
 
 
507 aa  132  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  38.31 
 
 
256 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.98 
 
 
242 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  38.31 
 
 
256 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  41.84 
 
 
305 aa  131  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  39.51 
 
 
255 aa  131  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  37.28 
 
 
236 aa  131  9e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  37.1 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3136  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.75 
 
 
251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  35.34 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  39.83 
 
 
519 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0866  protein serine/threonine phosphatase  36.89 
 
 
293 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  39 
 
 
426 aa  129  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  35.89 
 
 
262 aa  129  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  36.29 
 
 
325 aa  128  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0590  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.55 
 
 
241 aa  128  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  36.8 
 
 
274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  36.17 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  37.55 
 
 
421 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 
321 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  35.59 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>