118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02324 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  100 
 
 		 121 aa  243  9e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  71.55 
 
 		 121 aa  173  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  46.96 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  41.74 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  44.35 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 122 aa  104  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  43.7 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  42.24 
 
 		 133 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  42.48 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  42.24 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  43.1 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  43.1 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  42.24 
 
 		 133 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  41.74 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 124 aa  85.9  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  37.07 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1264  transcriptional repressor CopY, putative  33.91 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  33.33 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  29.46 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  28.23 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  31.58 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  26.72 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  28.07 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  28.45 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  28.45 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  31.78 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  29.2 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  29.2 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1354  transcriptional repressor, CopY family  37 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2747  CopY family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.513766  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2824  penicillinase repressor  27.59 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.167752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  29.41 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0005  penicillinase repressor  26.55 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.014635  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1301  transcriptional repressor, CopY family  25.64 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0225104  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1362  CopY family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  26.61 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  28.7 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  27.97 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  26.05 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  28.83 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  31.62 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0730  transcriptional repressor, CopY family  30.43 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0429  CopY family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2069  CopY family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  26.05 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  36.75 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0076  transcriptional repressor, CopY family  29.06 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726818  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  34.71 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2354  CopY family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000228636  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  27.35 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  26.36 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  22.12 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  31.03 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2772  CopY family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00766879  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  25.93 
 
 		 117 aa  50.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  26.45 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  28.32 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  24.07 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3145  transcriptional regulator  23.48 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2324  CopY family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  28.71 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  28.71 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  38.38 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  27.12 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  21.3 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  28.45 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0049  transcriptional regulator  23.97 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  41.18 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  36.49 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  26.89 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0165  transcriptional repressor, CopY family  24.32 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.272376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  27.27 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  37.5 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  37.66 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  25.21 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1287  transcriptional repressor, CopY family  22.22 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.58486  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1835  transcriptional repressor, CopY family  18.75 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  31.11 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  19.09 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0677  penicillinase repressor  26.79 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>