More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02093 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  100 
 
 
292 aa  591  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  66.79 
 
 
275 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  66.91 
 
 
289 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  38.57 
 
 
274 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  37.05 
 
 
274 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  36.61 
 
 
274 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  36.61 
 
 
274 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  37.05 
 
 
274 aa  152  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  36.41 
 
 
277 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  35.11 
 
 
274 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  35.11 
 
 
274 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  35.11 
 
 
274 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  34.67 
 
 
274 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  40.62 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  38.12 
 
 
274 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  35.1 
 
 
290 aa  132  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  33.82 
 
 
280 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  32.47 
 
 
274 aa  125  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  35.51 
 
 
280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  33.65 
 
 
275 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  33.02 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  29 
 
 
298 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  32.2 
 
 
292 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  25.81 
 
 
280 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  36.4 
 
 
340 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  33.96 
 
 
275 aa  106  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  32.88 
 
 
291 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  28.52 
 
 
303 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  28.44 
 
 
300 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  29.89 
 
 
369 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  30.85 
 
 
304 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 
297 aa  103  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 
284 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  24.38 
 
 
305 aa  100  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  28.05 
 
 
289 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  30.84 
 
 
299 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  34.03 
 
 
287 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  28.64 
 
 
287 aa  99.8  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  30.46 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  34.97 
 
 
258 aa  99.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  26.59 
 
 
274 aa  99.4  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  30.09 
 
 
299 aa  99.4  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  29.21 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  29.84 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
297 aa  97.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  27.86 
 
 
282 aa  97.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  32.74 
 
 
378 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  28 
 
 
279 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  31.16 
 
 
281 aa  96.3  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  28.71 
 
 
280 aa  96.3  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  26.76 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  31 
 
 
281 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  29.09 
 
 
455 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  33.65 
 
 
302 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  27.7 
 
 
289 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  32.99 
 
 
430 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  29.85 
 
 
353 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  31.77 
 
 
285 aa  93.6  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  29.85 
 
 
302 aa  93.2  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  29.78 
 
 
456 aa  93.2  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  28.43 
 
 
284 aa  92.4  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1996  putative signal transduction protein  30.29 
 
 
274 aa  92.4  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.490329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1708  putative signal transduction protein  30.29 
 
 
274 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.538449  normal  0.498965 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  28.5 
 
 
730 aa  92  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  32.58 
 
 
373 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  31.25 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  30.86 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  30.13 
 
 
425 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 
544 aa  90.5  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  31.63 
 
 
285 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 
282 aa  90.1  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  31.55 
 
 
352 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  28.37 
 
 
285 aa  89.4  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  30.47 
 
 
288 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  26.72 
 
 
408 aa  89  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  34.35 
 
 
293 aa  89  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  30.3 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  37.12 
 
 
409 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 
397 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 
406 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  30.27 
 
 
278 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  30.27 
 
 
278 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  30.54 
 
 
281 aa  86.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  27.96 
 
 
297 aa  86.7  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  27.23 
 
 
505 aa  86.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  30.05 
 
 
716 aa  86.7  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  29.03 
 
 
438 aa  86.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  28.79 
 
 
407 aa  86.3  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  27.08 
 
 
412 aa  85.9  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.16 
 
 
412 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1043  putative signal transduction protein  31.09 
 
 
288 aa  85.9  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  26.4 
 
 
427 aa  85.5  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  30.37 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  31.91 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  27.85 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  29.36 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  27.8 
 
 
351 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>