More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02051 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0021  clpB protein  45.07 
 
 		 869 aa  678    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0433  clpB protein, putative  49.39 
 
 		 875 aa  756    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2520  type VI secretion ATPase  44.7 
 
 		 863 aa  694    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  47.79 
 
 		 885 aa  752    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3095  chaperone-associated ATPase, putative  57.49 
 
 		 878 aa  977    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  71.68 
 
 		 891 aa  1221    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3864  type VI secretion ATPase  51.32 
 
 		 928 aa  784    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  72.28 
 
 		 889 aa  1251    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  74.78 
 
 		 905 aa  1324    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1482  ATPase  49.68 
 
 		 925 aa  761    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0170  AAA family ATPase  46.67 
 
 		 882 aa  716    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000964396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2548  clpB protein, putative  45.19 
 
 		 867 aa  710    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5425  clpB protein, putative  48.32 
 
 		 882 aa  755    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2982  AAA family ATPase  47.12 
 
 		 880 aa  734    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017738 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  71.86 
 
 		 897 aa  1249    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  50.55 
 
 		 884 aa  775    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0178  chaperone clpB  48.25 
 
 		 895 aa  732    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0732  type VI secretion ATPase  47.32 
 
 		 882 aa  722    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.759249  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3644  type VI secretion ATPase  46.26 
 
 		 902 aa  696    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.9184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4958  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  58.02 
 
 		 867 aa  1003    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  50.55 
 
 		 884 aa  775    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  76.37 
 
 		 899 aa  1352    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3069  ATPase  55.43 
 
 		 882 aa  913    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0322  type VI secretion ATPase  43.19 
 
 		 867 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0097  ATPase  48.84 
 
 		 866 aa  717    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  52.25 
 
 		 898 aa  865    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0395  type VI secretion ATPase  43.08 
 
 		 867 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5260  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:phosphopantetheine attachment site  46.34 
 
 		 913 aa  713    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  50.55 
 
 		 884 aa  775    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  71.93 
 
 		 889 aa  1241    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  50.87 
 
 		 916 aa  819    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1205  ATPase  42.98 
 
 		 873 aa  683    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  72.5 
 
 		 889 aa  1256    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  50.66 
 
 		 888 aa  781    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1625  SciG protein  48.48 
 
 		 918 aa  735    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398172  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00259  ClpB  50.78 
 
 		 901 aa  770    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388989  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  50.66 
 
 		 888 aa  779    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3412  ClpA/B-type protease  50.11 
 
 		 846 aa  753    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.219119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  47.79 
 
 		 885 aa  752    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5584  ClpB protein, putative  48.46 
 
 		 885 aa  771    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0156  chaperone clpB  48.48 
 
 		 895 aa  735    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3474  hypothetical protein  50.22 
 
 		 889 aa  761    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6115  type VI secretion ATPase  48.4 
 
 		 906 aa  741    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24944 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2820  heat shock protein ClpB-like  48.58 
 
 		 899 aa  754    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  71.76 
 
 		 889 aa  1241    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  71.54 
 
 		 889 aa  1227    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0979  AAA ATPase, Clp  48.23 
 
 		 893 aa  739    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1582  AAA ATPase, Clp  50.83 
 
 		 887 aa  781    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  71.86 
 
 		 897 aa  1249    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2769  type VI secretion ATPase  57.89 
 
 		 865 aa  989    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186875  normal  0.804579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3315  AAA ATPase  50.39 
 
 		 878 aa  745    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3255  type VI secretion ATPase  45.12 
 
 		 884 aa  689    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  50.77 
 
 		 888 aa  781    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0140  ClpA/B type protease  47.96 
 
 		 918 aa  734    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0264  ClpA/B type protease  50.77 
 
 		 885 aa  775    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0298  ClpV1 family type VI secretion ATPase  45.64 
 
 		 879 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.140659 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  72.39 
 
 		 889 aa  1253    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  71.95 
 
 		 887 aa  1241    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0303  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  46.09 
 
 		 887 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649065  normal  0.656234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3610  type VI secretion ATPase  48.56 
 
 		 875 aa  735    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  49.57 
 
 		 900 aa  807    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6693  type VI secretion ATPase  50.28 
 
 		 889 aa  746    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0310  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  45.64 
 
 		 879 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  47.33 
 
 		 897 aa  785    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2505  AAA family ATPase  47.99 
 
 		 880 aa  736    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2096  putative ClpA/B-type chaperone, ATPase subunit ClpB, heat shock protein  47.97 
 
 		 916 aa  741    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  45.74 
 
 		 895 aa  719    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  50.55 
 
 		 884 aa  775    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2273  ATPase AAA-2  57.16 
 
 		 889 aa  973    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5984  type VI secretion ATPase  53.33 
 
 		 909 aa  865    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  50.5 
 
 		 889 aa  779    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0618  ATPase AAA-2  47.42 
 
 		 893 aa  734    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0224161 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0942  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  48.29 
 
 		 906 aa  731    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  71.65 
 
 		 889 aa  1230    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  47.08 
 
 		 894 aa  781    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0804  type VI secretion ATPase  47.12 
 
 		 880 aa  731    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  72.39 
 
 		 889 aa  1253    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2632  ATPase AAA-2  76.12 
 
 		 681 aa  1006    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0162  type VI secretion ATPase  51.15 
 
 		 902 aa  849    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.475088  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0229  type VI secretion ATPase  43.36 
 
 		 923 aa  652    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3008  type VI secretion ATPase  48.53 
 
 		 887 aa  739    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3906  type VI secretion ATPase  48.29 
 
 		 893 aa  716    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.356382 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0231  ATP-dependent chaperone protein ClpB  43.27 
 
 		 919 aa  650    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2362  ATPase  49.45 
 
 		 868 aa  837    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488644  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  72.39 
 
 		 889 aa  1253    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  71.54 
 
 		 889 aa  1230    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2890  type VI secretion ATPase  50.28 
 
 		 849 aa  745    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3473  ATPase  49.94 
 
 		 897 aa  745    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150348  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01100  putative ClpA/B-type chaperone  51.16 
 
 		 902 aa  848    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33990  putative ClpA/B-type protease  50.79 
 
 		 849 aa  753    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000016123  normal  0.0826946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  48.69 
 
 		 877 aa  749    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2505  type VI secretion ATPase  57.96 
 
 		 865 aa  1000    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3129  ClpA/ClpB family protein  45.91 
 
 		 881 aa  717    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  71.65 
 
 		 889 aa  1229    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1789  ATPase  47.2 
 
 		 884 aa  756    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  47.68 
 
 		 891 aa  749    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02051  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  100 
 
 		 910 aa  1841    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2440  ATPase  51.09 
 
 		 915 aa  776    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217736  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2627  ATPase  57.38 
 
 		 865 aa  977    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3013  ATPase  51.89 
 
 		 887 aa  792    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>