152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02050 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  733    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  52.47 
 
 
363 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  51.22 
 
 
366 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  51.22 
 
 
366 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  51.22 
 
 
366 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  51.22 
 
 
366 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  51.22 
 
 
366 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  50.95 
 
 
366 aa  361  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  50.68 
 
 
366 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  52.86 
 
 
364 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  50.68 
 
 
366 aa  355  5e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  50.68 
 
 
366 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  50.68 
 
 
366 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  50.68 
 
 
366 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  50.68 
 
 
366 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  50.68 
 
 
366 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  50.68 
 
 
366 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  46.93 
 
 
354 aa  347  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  50.15 
 
 
338 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  36.1 
 
 
356 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  35.82 
 
 
356 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  35.65 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  36.1 
 
 
356 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  36.1 
 
 
356 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  32.85 
 
 
359 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  34.8 
 
 
330 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.03 
 
 
343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  34.82 
 
 
377 aa  139  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  31.66 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  32.37 
 
 
388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  30.75 
 
 
348 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.55 
 
 
344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  32.47 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  30.99 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.84 
 
 
349 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  30.72 
 
 
338 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  31.58 
 
 
337 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  32.95 
 
 
385 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  31.87 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  31.48 
 
 
369 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  30.21 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  32.44 
 
 
370 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0739  hypothetical protein  31.83 
 
 
340 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.876468  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0609  hypothetical protein  31.83 
 
 
340 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0735963  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0720  hypothetical protein  31.83 
 
 
340 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2482  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1678  hypothetical protein  31.83 
 
 
340 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2128  hypothetical protein  31.83 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.596577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2030  hypothetical protein  31.83 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23868  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0539  hypothetical protein  31.83 
 
 
340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  28.72 
 
 
357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  29.49 
 
 
362 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.31 
 
 
349 aa  112  9e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  29.58 
 
 
358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  27.19 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  27.11 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  28.62 
 
 
329 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  26.81 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  31.36 
 
 
366 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  26.79 
 
 
309 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  29.79 
 
 
330 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0865  hypothetical protein  28.2 
 
 
351 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.839785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  28.4 
 
 
335 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  31.19 
 
 
361 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  31.19 
 
 
361 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  31.19 
 
 
361 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  30.27 
 
 
358 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  29.76 
 
 
367 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.54 
 
 
346 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.11 
 
 
337 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  31.19 
 
 
361 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  31.19 
 
 
361 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  31.19 
 
 
361 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  24.62 
 
 
337 aa  103  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  28.31 
 
 
335 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  29.49 
 
 
351 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.9 
 
 
332 aa  102  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  25.87 
 
 
335 aa  102  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5585  hypothetical protein  28.44 
 
 
308 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  27.47 
 
 
335 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  28.9 
 
 
357 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.61 
 
 
332 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  31.72 
 
 
341 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  30.14 
 
 
361 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  28 
 
 
335 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2547  hypothetical protein  28.97 
 
 
335 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186955  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  28.05 
 
 
427 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  24.43 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  24.72 
 
 
338 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  30.51 
 
 
311 aa  92.8  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  30.51 
 
 
331 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  30.51 
 
 
331 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50850  hypothetical protein  30.92 
 
 
340 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0823811  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  29.97 
 
 
352 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  28.35 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  24.64 
 
 
338 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4078  hypothetical protein  24.36 
 
 
338 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0252169  hitchhiker  0.00001492 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  23.03 
 
 
356 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  30.15 
 
 
331 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6045  hypothetical protein  29.1 
 
 
336 aa  90.1  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  23.03 
 
 
343 aa  90.1  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>