59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02005 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02005  17 kDa surface antigen family protein  100 
 
 
189 aa  362  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  31.25 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2507  17 kDa surface antigen  47.37 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.424442  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  31.97 
 
 
175 aa  62  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  37.37 
 
 
179 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  35.64 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  35.64 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  35.64 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  35.29 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  35.64 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  35.64 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  35.64 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  36.36 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  36.36 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  36.36 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  36.36 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  36.36 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  36.36 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  36.36 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3351  histidine kinase  32.58 
 
 
185 aa  52.4  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000036604  normal  0.060501 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  35.35 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3376  17 kDa surface antigen  40.51 
 
 
214 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  33.33 
 
 
218 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  33.33 
 
 
218 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  33.33 
 
 
218 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  33.33 
 
 
218 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  33.33 
 
 
218 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  32.35 
 
 
208 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1232  hypothetical protein  30.07 
 
 
179 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.4462  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1417  hypothetical protein  30.72 
 
 
179 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  33.33 
 
 
218 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1858  17 kDa surface antigen  38.96 
 
 
223 aa  47.8  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.699281  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2356  putative outer membrane lipoprotein  36.09 
 
 
190 aa  47.8  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.662558  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  29.68 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4617  hypothetical protein  28.76 
 
 
182 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00650185  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4774  17 kDa surface antigen  36.89 
 
 
213 aa  45.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0665442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1954  17 kDa surface antigen  35.05 
 
 
206 aa  45.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000188726  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04806  outer membrane protein  32.34 
 
 
263 aa  45.1  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2791  hypothetical protein  36.63 
 
 
179 aa  44.7  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1377  surface antigen protein  41.77 
 
 
146 aa  44.7  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113314  normal  0.0505694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3516  hypothetical protein  35.11 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.672109 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  34.65 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  34.65 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1122  17 kDa surface antigen  35.45 
 
 
430 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0880  hypothetical protein  29.14 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0587539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1294  hypothetical protein  34.38 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2741  17 kDa surface antigen  38.96 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.29195  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  42.31 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2231  17 kDa surface antigen  38.96 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.302899  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  30.1 
 
 
206 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4341  hypothetical protein  28.48 
 
 
177 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.4665  hitchhiker  0.0000000405508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0867  hypothetical protein  28.48 
 
 
176 aa  42  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430194  normal  0.573966 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  30.1 
 
 
204 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1384  17 kDa surface antigen  32 
 
 
376 aa  42  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2485  hypothetical protein  34.65 
 
 
179 aa  42  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  33.66 
 
 
179 aa  41.6  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  42.86 
 
 
156 aa  42  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  36.36 
 
 
179 aa  41.6  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>