171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01995 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  474  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  78.51 
 
 
235 aa  363  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  49.49 
 
 
211 aa  194  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  46.41 
 
 
215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  47.67 
 
 
209 aa  185  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  45 
 
 
210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  48.44 
 
 
212 aa  182  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  46.91 
 
 
208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  46.91 
 
 
208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  46.67 
 
 
215 aa  181  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  45.45 
 
 
210 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  43.06 
 
 
204 aa  180  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  44.55 
 
 
202 aa  178  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  47.42 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  47.42 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  40.48 
 
 
217 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  47 
 
 
214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  42.41 
 
 
204 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  41.36 
 
 
204 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  41.88 
 
 
204 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  48.21 
 
 
211 aa  165  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  47.5 
 
 
211 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  39.34 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  41.24 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  46.5 
 
 
211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  42.05 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  38.86 
 
 
217 aa  162  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  45.23 
 
 
209 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  43.75 
 
 
204 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  44.27 
 
 
200 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  44.27 
 
 
200 aa  158  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  40.51 
 
 
203 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  39.11 
 
 
211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  42.71 
 
 
201 aa  155  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  37.98 
 
 
228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  43.37 
 
 
237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  37.98 
 
 
228 aa  151  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  38.94 
 
 
208 aa  151  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  40.09 
 
 
203 aa  148  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  41.84 
 
 
237 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  40.1 
 
 
234 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  41.88 
 
 
202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  42.41 
 
 
202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  46.11 
 
 
233 aa  132  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  37.5 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  39.73 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  36.23 
 
 
215 aa  126  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  37.25 
 
 
237 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  36.79 
 
 
215 aa  122  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  40.62 
 
 
202 aa  122  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  34.98 
 
 
204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  35.6 
 
 
205 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  35.6 
 
 
200 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  34.44 
 
 
217 aa  108  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  35.42 
 
 
198 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  35.05 
 
 
212 aa  104  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  35.84 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  43.75 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  29.28 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  31.69 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  24.71 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  28.73 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  30.34 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  37.58 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  26.28 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  28.98 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  27.68 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  25.27 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  29.31 
 
 
283 aa  63.9  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  25.57 
 
 
283 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4891  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4733  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4748  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5133  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5265  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3612  hypothetical protein  29.19 
 
 
297 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5163  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5178  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4850  hypothetical protein  27.98 
 
 
297 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5168  hypothetical protein  27.98 
 
 
297 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0080  hypothetical protein  27.98 
 
 
297 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  28.57 
 
 
311 aa  58.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  25.17 
 
 
299 aa  58.5  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  28.77 
 
 
290 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  26.25 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  24.29 
 
 
289 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2353  protein of unknown function DUF161  25.48 
 
 
191 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  30.32 
 
 
323 aa  55.5  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0494  hypothetical protein  28.24 
 
 
298 aa  55.1  0.0000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0958  hypothetical protein  26.88 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  31.01 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  26.16 
 
 
285 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0393  hypothetical protein  25.45 
 
 
290 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0880  hypothetical protein  24.06 
 
 
285 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3548  protein of unknown function DUF161  30.11 
 
 
288 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0389  hypothetical protein  29.81 
 
 
283 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0967  hypothetical protein  27.98 
 
 
281 aa  52.4  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.69732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  26 
 
 
290 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1072  hypothetical protein  23.53 
 
 
293 aa  52  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2170  hypothetical protein  25 
 
 
290 aa  52  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000241108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>