More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01939 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  100 
 
 		 795 aa  1607    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  45.29 
 
 		 800 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  45.38 
 
 		 800 aa  638    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  50.56 
 
 		 793 aa  746    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  69.64 
 
 		 788 aa  1150    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  48.18 
 
 		 799 aa  640    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  54.39 
 
 		 795 aa  800    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  50.31 
 
 		 793 aa  744    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  56.94 
 
 		 784 aa  842    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  69.51 
 
 		 788 aa  1149    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  39.86 
 
 		 853 aa  534  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  40.96 
 
 		 843 aa  531  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  40.29 
 
 		 803 aa  521  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  39.76 
 
 		 803 aa  510  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  38.81 
 
 		 811 aa  508  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  40.35 
 
 		 797 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  40.35 
 
 		 797 aa  502  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  39.98 
 
 		 817 aa  501  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  39.78 
 
 		 812 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  39.78 
 
 		 812 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  39.78 
 
 		 812 aa  500  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  40.1 
 
 		 797 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  40.17 
 
 		 797 aa  499  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  38.82 
 
 		 811 aa  483  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  38.38 
 
 		 797 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  37.65 
 
 		 795 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  38.47 
 
 		 815 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  36.6 
 
 		 853 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  36.68 
 
 		 840 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  38.01 
 
 		 811 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  38.24 
 
 		 800 aa  430  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 		 948 aa  429  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  35.7 
 
 		 933 aa  428  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  35.96 
 
 		 835 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 		 817 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 847 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  36.95 
 
 		 815 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  35.44 
 
 		 823 aa  412  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  35.55 
 
 		 961 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  36.82 
 
 		 821 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 871 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.22 
 
 		 832 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  34.54 
 
 		 918 aa  396  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  32.99 
 
 		 856 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  34.06 
 
 		 848 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  33.26 
 
 		 868 aa  382  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 851 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  35.76 
 
 		 884 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  33.22 
 
 		 870 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  36.1 
 
 		 842 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  33.61 
 
 		 818 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  31.29 
 
 		 1015 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  34.99 
 
 		 883 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  33.53 
 
 		 864 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 924 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  34.24 
 
 		 867 aa  369  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  34.31 
 
 		 804 aa  364  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  33.13 
 
 		 833 aa  360  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  34.27 
 
 		 847 aa  360  8e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 874 aa  356  1e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 987 aa  355  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 885 aa  354  5e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 813 aa  340  5e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  34.12 
 
 		 924 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 842 aa  332  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 887 aa  330  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 872 aa  328  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 		 947 aa  314  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 816 aa  313  5.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 850 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 849 aa  291  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 873 aa  287  5e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 852 aa  283  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 879 aa  270  8e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  30.88 
 
 		 948 aa  240  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 		 858 aa  235  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  34.42 
 
 		 861 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 867 aa  226  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 867 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 857 aa  222  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 870 aa  207  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 		 877 aa  207  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 869 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 858 aa  175  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  27.64 
 
 		 839 aa  150  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 867 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 897 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 869 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 867 aa  134  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 953 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  36.4 
 
 		 910 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  38.66 
 
 		 871 aa  115  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  39.15 
 
 		 904 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  36.76 
 
 		 904 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  37.61 
 
 		 836 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  38.66 
 
 		 852 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  38.66 
 
 		 861 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  38.66 
 
 		 861 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  38.66 
 
 		 861 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  36.71 
 
 		 873 aa  112  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>