48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01781 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01781  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  546  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  33.21 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  30.12 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  30.12 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0461  hypothetical protein  30.15 
 
 		 240 aa  99  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1695  hypothetical protein  28.24 
 
 		 238 aa  89.7  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0088  hypothetical protein  27.88 
 
 		 239 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0073  hypothetical protein  27.68 
 
 		 239 aa  88.6  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  30.38 
 
 		 233 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  29.55 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4573  hypothetical protein  31.34 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1269  hypothetical protein  30.35 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174467 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1826  hypothetical protein  27.61 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0616664  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0400  uncharacterized protein-like protein  30.42 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4227  hypothetical protein  26.79 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3668  hypothetical protein  26.37 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5177  hypothetical protein  29.3 
 
 		 235 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0972  hypothetical protein  28.29 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1647  hypothetical protein  29.23 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.042207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0361  hypothetical protein  30.23 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0162  hypothetical protein  27.21 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3908  hypothetical protein  27.46 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  29.5 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1137  hypothetical protein  26.97 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0076  hypothetical protein  26.39 
 
 		 236 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3537  hypothetical protein  27.17 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3747  hypothetical protein  30 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831367  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1097  hypothetical protein  24.42 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  29.34 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3056  hypothetical protein  27.27 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3783  hypothetical protein  27.69 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.619325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5507  uncharacterized protein-like protein  28.63 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2362  hypothetical protein  27.92 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2687  hypothetical protein  26.85 
 
 		 230 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3491  hypothetical protein  44.44 
 
 		 696 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445779  normal  0.366165 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01570  hypothetical protein  27.52 
 
 		 244 aa  52.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2576  putative transmembrane protein  27.69 
 
 		 239 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2172  hypothetical protein  27.69 
 
 		 239 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1295  hypothetical protein  28.68 
 
 		 237 aa  48.9  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3920  uncharacterized protein-like protein  29.32 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00106031  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5200  hypothetical protein  26.79 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3889  uncharacterized protein-like protein  37.88 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4257  uncharacterized protein-like protein  37.88 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4013  uncharacterized protein-like protein  25.19 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2635  hypothetical protein  24.38 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3005  hypothetical protein  25.56 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660261  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1085  putative transmembrane protein  24.24 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  25.72 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>