More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01715 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  100 
 
 		 266 aa  547  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1442  Signal peptidase I  77.07 
 
 		 264 aa  412  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1373  signal peptidase I  76.69 
 
 		 264 aa  410  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  68.01 
 
 		 264 aa  365  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  51.92 
 
 		 262 aa  259  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  50.37 
 
 		 266 aa  258  5.0000000000000005e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  50.37 
 
 		 267 aa  255  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  50.95 
 
 		 255 aa  250  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  49.81 
 
 		 256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  47.15 
 
 		 248 aa  226  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  47.15 
 
 		 248 aa  226  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  46.72 
 
 		 263 aa  222  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  42.76 
 
 		 305 aa  216  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  42.95 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  43.38 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  42.7 
 
 		 270 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  41.75 
 
 		 300 aa  211  7e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  43.67 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  43.67 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  43.67 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  43.67 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  43.67 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  43.67 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  43.67 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  40.86 
 
 		 305 aa  209  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  43.62 
 
 		 305 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  41.38 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  42.61 
 
 		 269 aa  205  7e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  41.22 
 
 		 304 aa  205  8e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  40.34 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  42.11 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  42 
 
 		 305 aa  203  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  42.11 
 
 		 284 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  45.34 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  42.11 
 
 		 284 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  41.39 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  42.11 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  42.86 
 
 		 284 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  42 
 
 		 304 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  45.34 
 
 		 251 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  39.02 
 
 		 305 aa  201  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  40.67 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  42.11 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  40.48 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  44.44 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  41.95 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  41.97 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  42.67 
 
 		 300 aa  199  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  40 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  40.73 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  47.49 
 
 		 284 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  43.06 
 
 		 305 aa  198  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  39.66 
 
 		 297 aa  198  9e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  47.03 
 
 		 284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  47.03 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  47.25 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  45.22 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  44.95 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  39.02 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  42.07 
 
 		 262 aa  193  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  42.19 
 
 		 263 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  42.19 
 
 		 263 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  40.4 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0331  signal peptidase I  40.91 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  43.56 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0365  peptidase S26A, signal peptidase I  41.18 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  39.09 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  38.75 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  38.46 
 
 		 332 aa  185  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  38.14 
 
 		 332 aa  184  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  38.14 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  39.27 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  41.73 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  40.46 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  38.54 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  38.21 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  38.54 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  38.54 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  39.4 
 
 		 324 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  39.4 
 
 		 324 aa  179  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  37.46 
 
 		 322 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  38.76 
 
 		 321 aa  179  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  39.2 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  39.4 
 
 		 324 aa  179  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  39.4 
 
 		 324 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  39.4 
 
 		 324 aa  179  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  39.4 
 
 		 324 aa  179  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  39.4 
 
 		 324 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  39.4 
 
 		 324 aa  179  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  41 
 
 		 262 aa  179  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  38.06 
 
 		 321 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  38.81 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  39.26 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  38 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  38.21 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  38.21 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  36.67 
 
 		 322 aa  175  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  41.13 
 
 		 324 aa  175  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  44.44 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  38.03 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>