79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01697 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  58.65 
 
 		 638 aa  678    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  100 
 
 		 581 aa  1189    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  37.81 
 
 		 690 aa  450  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.91 
 
 		 704 aa  430  1e-119  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.65 
 
 		 709 aa  431  1e-119  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.25 
 
 		 487 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  36.25 
 
 		 704 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.34 
 
 		 698 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.25 
 
 		 687 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.82 
 
 		 688 aa  340  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  35.28 
 
 		 932 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  35.28 
 
 		 750 aa  317  5e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  38.37 
 
 		 463 aa  290  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  35.02 
 
 		 470 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  32.99 
 
 		 606 aa  280  6e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  35.81 
 
 		 410 aa  239  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  36.89 
 
 		 434 aa  239  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  34.32 
 
 		 460 aa  230  6e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  34.17 
 
 		 460 aa  228  3e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0652  F5/8 type C domain-containing protein  24.29 
 
 		 436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0313432  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0640  F5/8 type C domain-containing protein  23.88 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.78 
 
 		 467 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  28.71 
 
 		 435 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  28.9 
 
 		 435 aa  107  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  27.62 
 
 		 674 aa  104  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  29.01 
 
 		 440 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  29 
 
 		 441 aa  94  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  28.35 
 
 		 445 aa  93.6  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  28.22 
 
 		 340 aa  93.6  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  26.84 
 
 		 479 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  27.7 
 
 		 429 aa  91.3  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  35.62 
 
 		 450 aa  90.5  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  27.33 
 
 		 431 aa  88.2  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  35.26 
 
 		 478 aa  88.2  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  28.33 
 
 		 429 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  36.92 
 
 		 474 aa  86.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  33.78 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  28.52 
 
 		 581 aa  84.3  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  25.94 
 
 		 596 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  25.16 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  26.3 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  26.35 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  26.33 
 
 		 471 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  24.92 
 
 		 479 aa  77  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  26.03 
 
 		 711 aa  76.3  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  25.8 
 
 		 485 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  24.84 
 
 		 494 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  24.08 
 
 		 538 aa  73.2  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  24.45 
 
 		 644 aa  73.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  26 
 
 		 627 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  24.24 
 
 		 415 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  23.86 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  28.23 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  27.89 
 
 		 446 aa  67  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  23.99 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  24.47 
 
 		 482 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  27.46 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  25.71 
 
 		 1967 aa  54.3  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1472  putative alpha-N-acetylgalactosaminidase  29.66 
 
 		 1588 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 		 212 aa  52.8  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  26.69 
 
 		 463 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4324  coagulation factor 5/8 type, C-terminal  31.28 
 
 		 223 aa  51.2  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.010102  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  33.72 
 
 		 505 aa  50.8  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.83 
 
 		 1329 aa  50.4  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  43.1 
 
 		 471 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  40 
 
 		 478 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  33.73 
 
 		 484 aa  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  23.71 
 
 		 490 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  32.18 
 
 		 464 aa  48.9  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.57 
 
 		 1264 aa  48.1  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  22.83 
 
 		 534 aa  47.4  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 		 584 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 		 606 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  34.88 
 
 		 466 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.12 
 
 		 1289 aa  46.2  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 		 532 aa  45.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  30.23 
 
 		 537 aa  44.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  31.76 
 
 		 495 aa  44.7  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  36.84 
 
 		 474 aa  43.9  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>