185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01641 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.9 
 
 
821 aa  667    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  66.98 
 
 
812 aa  1001    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  66.35 
 
 
812 aa  1025    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  100 
 
 
736 aa  1502    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.06 
 
 
785 aa  590  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.62 
 
 
781 aa  581  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.13 
 
 
618 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.85 
 
 
613 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  39.9 
 
 
776 aa  426  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.39 
 
 
795 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.26 
 
 
533 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.39 
 
 
790 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.66 
 
 
526 aa  415  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  37.48 
 
 
795 aa  411  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.43 
 
 
634 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.69 
 
 
762 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.25 
 
 
779 aa  402  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.67 
 
 
772 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.06 
 
 
553 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  40.07 
 
 
777 aa  396  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.78 
 
 
775 aa  399  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.58 
 
 
609 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.86 
 
 
766 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.54 
 
 
774 aa  395  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.83 
 
 
542 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.03 
 
 
905 aa  386  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.19 
 
 
605 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.76 
 
 
527 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.89 
 
 
534 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.76 
 
 
618 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.21 
 
 
505 aa  362  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.02 
 
 
655 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.63 
 
 
765 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.75 
 
 
546 aa  353  5e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.05 
 
 
779 aa  353  8e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.45 
 
 
613 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.53 
 
 
534 aa  343  7e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.9 
 
 
549 aa  336  1e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.26 
 
 
834 aa  334  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.99 
 
 
760 aa  333  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  40.51 
 
 
469 aa  316  9.999999999999999e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  41.61 
 
 
614 aa  312  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  37.47 
 
 
639 aa  311  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  38.51 
 
 
639 aa  310  5e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  40.69 
 
 
637 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.42 
 
 
422 aa  303  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  40.09 
 
 
543 aa  301  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.22 
 
 
665 aa  301  4e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.15 
 
 
628 aa  297  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.27 
 
 
525 aa  294  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.47 
 
 
545 aa  290  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  39.8 
 
 
602 aa  289  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.73 
 
 
547 aa  287  4e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.8 
 
 
447 aa  285  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.92 
 
 
529 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  37.91 
 
 
639 aa  277  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.23 
 
 
636 aa  271  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.62 
 
 
688 aa  270  5e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.5 
 
 
481 aa  269  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.08 
 
 
549 aa  268  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.36 
 
 
636 aa  268  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.35 
 
 
627 aa  263  6e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.1 
 
 
683 aa  262  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  38 
 
 
639 aa  262  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.83 
 
 
688 aa  259  9e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.86 
 
 
515 aa  255  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.44 
 
 
673 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.9 
 
 
593 aa  254  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.18 
 
 
584 aa  253  7e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.38 
 
 
794 aa  253  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.59 
 
 
673 aa  250  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.91 
 
 
858 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  40 
 
 
797 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.27 
 
 
528 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  34.24 
 
 
558 aa  238  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.54 
 
 
525 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.63 
 
 
493 aa  236  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.49 
 
 
504 aa  233  1e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  34.23 
 
 
1140 aa  232  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.15 
 
 
811 aa  231  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  32.78 
 
 
816 aa  226  8e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  34.75 
 
 
807 aa  221  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.72 
 
 
676 aa  218  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.87 
 
 
866 aa  207  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.03 
 
 
778 aa  205  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.65 
 
 
489 aa  201  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  32 
 
 
820 aa  198  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.58 
 
 
533 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.36 
 
 
518 aa  196  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.26 
 
 
500 aa  191  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.26 
 
 
852 aa  191  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.69 
 
 
853 aa  190  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.01 
 
 
857 aa  187  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  29.77 
 
 
889 aa  180  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.68 
 
 
863 aa  179  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.27 
 
 
868 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.68 
 
 
913 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.06 
 
 
913 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.03 
 
 
910 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1232  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.71 
 
 
885 aa  171  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12617  normal  0.176702 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>