More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01607 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  46.18 
 
 
1987 aa  647  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 
2423 aa  649  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 
2539 aa  637  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  48.04 
 
 
1992 aa  646  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  64.52 
 
 
1725 aa  1134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  64.78 
 
 
1725 aa  1140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  47.92 
 
 
1971 aa  654  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  100 
 
 
2301 aa  4574  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  45.58 
 
 
2336 aa  644  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  46.28 
 
 
1834 aa  644  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  81.63 
 
 
2212 aa  1261  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  54.62 
 
 
1974 aa  634  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 
1758 aa  632  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 
1832 aa  626  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  51.2 
 
 
2458 aa  596  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  50.96 
 
 
2476 aa  596  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  47.57 
 
 
1646 aa  592  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  47.43 
 
 
1646 aa  592  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  46.51 
 
 
1629 aa  590  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  47.39 
 
 
1647 aa  589  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  39.9 
 
 
2301 aa  557  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 
1609 aa  547  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.47 
 
 
1960 aa  540  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  38.23 
 
 
2284 aa  534  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  41.4 
 
 
1866 aa  534  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  40.89 
 
 
2048 aa  536  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 
2012 aa  530  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  39.68 
 
 
1989 aa  521  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  40.84 
 
 
1956 aa  523  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 
2009 aa  520  1e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  39.79 
 
 
1643 aa  518  1e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 
2175 aa  518  1e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  39.67 
 
 
1888 aa  501  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
2022 aa  498  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
2164 aa  491  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  45.19 
 
 
2092 aa  484  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  37.67 
 
 
1970 aa  486  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 
1907 aa  482  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
2026 aa  482  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  38.88 
 
 
1983 aa  479  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  38.28 
 
 
2026 aa  480  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  42.95 
 
 
2070 aa  472  1e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 
2414 aa  468  1e-130  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
2137 aa  455  1e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.63 
 
 
2325 aa  365  8e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 
1155 aa  329  4e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 
934 aa  328  1e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  33.39 
 
 
1616 aa  326  4e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
1125 aa  323  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
1137 aa  322  7e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
1078 aa  317  2e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
911 aa  311  9e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
1127 aa  309  4e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  32 
 
 
1197 aa  307  2e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.33 
 
 
1029 aa  305  6e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.08 
 
 
1180 aa  305  9e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
742 aa  303  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  33.2 
 
 
783 aa  303  3e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
1098 aa  303  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
928 aa  302  6e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  32.94 
 
 
785 aa  301  8e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
1098 aa  300  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  33.4 
 
 
770 aa  298  1e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
741 aa  298  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  32.95 
 
 
770 aa  297  2e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
1736 aa  296  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  32.55 
 
 
769 aa  293  3e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
783 aa  292  5e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  30.12 
 
 
734 aa  292  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  32.55 
 
 
769 aa  292  7e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  32.55 
 
 
769 aa  291  9e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  35.32 
 
 
803 aa  289  4e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
740 aa  288  8e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  33.33 
 
 
774 aa  286  2e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
755 aa  284  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
1065 aa  283  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  1.40381e-06 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.54 
 
 
764 aa  283  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
952 aa  281  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  30.9 
 
 
768 aa  280  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 
1012 aa  279  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 
777 aa  278  7e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  31.97 
 
 
801 aa  278  9e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.03 
 
 
974 aa  277  2e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  31.86 
 
 
878 aa  275  5e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
679 aa  275  7e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.13 
 
 
764 aa  273  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
989 aa  273  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
989 aa  273  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
762 aa  272  6e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
760 aa  270  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
756 aa  270  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
801 aa  270  3e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  30.13 
 
 
1020 aa  268  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
765 aa  268  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
781 aa  267  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
941 aa  266  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  1.59984e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
767 aa  266  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  38.54 
 
 
839 aa  266  5e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  33.4 
 
 
798 aa  265  8e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  30.11 
 
 
752 aa  264  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>