More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01604 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  100 
 
 		 176 aa  354  3.9999999999999996e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  83.52 
 
 		 176 aa  276  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  74.43 
 
 		 176 aa  268  4e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  74.43 
 
 		 176 aa  268  4e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  35.8 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  34.48 
 
 		 177 aa  101  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  27.43 
 
 		 178 aa  97.8  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  30.68 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  35.8 
 
 		 183 aa  95.5  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  32.2 
 
 		 179 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  32.2 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  32.57 
 
 		 178 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  32.39 
 
 		 178 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  34.9 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  33.56 
 
 		 176 aa  89  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  32.57 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  31.07 
 
 		 184 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  32.57 
 
 		 184 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  32 
 
 		 184 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  30.86 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  29.89 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  30.34 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  30.57 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  29.44 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  33.77 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2398  CheW protein  38.1 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.773649 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  25.25 
 
 		 478 aa  57.8  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  35.16 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  36.72 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  33.98 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  30.77 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  30.2 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  24.8 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  34.04 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  31.31 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  26.87 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  32.14 
 
 		 515 aa  55.1  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  26.79 
 
 		 907 aa  54.7  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3188  twitching motility signal transduction protein  41.67 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.572564  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  30.93 
 
 		 518 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  30.86 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.65 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  29.79 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  24.58 
 
 		 520 aa  52.4  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  29.03 
 
 		 141 aa  52.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  27.03 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  29.79 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  22.78 
 
 		 159 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  38.16 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  30.07 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  26.96 
 
 		 139 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  54.76 
 
 		 320 aa  51.2  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  25 
 
 		 189 aa  51.2  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  28.87 
 
 		 155 aa  51.2  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  36.11 
 
 		 779 aa  51.2  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  28.16 
 
 		 156 aa  50.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  28.16 
 
 		 156 aa  50.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  28 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  37.84 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  37.84 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  27.68 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  30.85 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  37.18 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  26.95 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  34.15 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  29.03 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  27.83 
 
 		 158 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  32.95 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  29.14 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  31.4 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  29 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  26.67 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  28.12 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  28.65 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  27.84 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  31.4 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  25.19 
 
 		 141 aa  49.3  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  29.07 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  28.12 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  34.12 
 
 		 152 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  34.12 
 
 		 152 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  40.38 
 
 		 314 aa  48.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3972  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  32.39 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  hitchhiker  0.0039114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0598  CheW protein  38.33 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  29.1 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  27.43 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  24.56 
 
 		 146 aa  48.5  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  28.46 
 
 		 155 aa  48.5  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0723  putative CheW protein  33.33 
 
 		 142 aa  48.5  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  22.08 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  22.08 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  38.46 
 
 		 314 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0802  chemotaxis protein CheV  33.33 
 
 		 299 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  38.46 
 
 		 314 aa  47.8  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  34.67 
 
 		 150 aa  47.8  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  30.23 
 
 		 164 aa  47.8  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  38.46 
 
 		 314 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  33.33 
 
 		 299 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  38.46 
 
 		 314 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  30.86 
 
 		 173 aa  47.8  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>