More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01567 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  100 
 
 		 213 aa  437  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  83.1 
 
 		 233 aa  370  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  76.3 
 
 		 217 aa  348  4e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  76.3 
 
 		 217 aa  348  5e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  72.51 
 
 		 227 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  69.19 
 
 		 223 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  69.34 
 
 		 216 aa  300  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  68.25 
 
 		 215 aa  299  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  67.77 
 
 		 215 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  67.14 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  67.14 
 
 		 215 aa  295  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  66.35 
 
 		 215 aa  291  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  64.79 
 
 		 213 aa  289  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  67.62 
 
 		 226 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  64.29 
 
 		 212 aa  285  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  65.4 
 
 		 215 aa  284  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  64.93 
 
 		 215 aa  284  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  64.93 
 
 		 215 aa  284  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  64.93 
 
 		 215 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  62.38 
 
 		 234 aa  280  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  60.66 
 
 		 212 aa  279  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  61.61 
 
 		 217 aa  275  5e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  61.03 
 
 		 213 aa  273  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  61.03 
 
 		 213 aa  273  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  61.9 
 
 		 216 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  61.9 
 
 		 214 aa  271  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  61.43 
 
 		 217 aa  271  6e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  61.9 
 
 		 214 aa  271  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  60.48 
 
 		 227 aa  261  4.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  60.19 
 
 		 232 aa  258  6e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  65.1 
 
 		 193 aa  253  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  62.2 
 
 		 215 aa  249  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  53.33 
 
 		 245 aa  249  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  51.56 
 
 		 244 aa  243  9.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  51.11 
 
 		 244 aa  240  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  49.27 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  49.27 
 
 		 210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  47.8 
 
 		 210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  48.29 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  48.79 
 
 		 215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  45.41 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  44.76 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  45.97 
 
 		 211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  45.09 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  42.86 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  42.06 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  44.55 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  42.18 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  40.65 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  41.98 
 
 		 223 aa  165  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  39.34 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  43.14 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  42.57 
 
 		 202 aa  151  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  41.18 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  33.18 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  36.23 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  36.73 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  30.89 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  32.5 
 
 		 258 aa  102  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  35.4 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  35.56 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  40.34 
 
 		 274 aa  96.3  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  41.18 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 280 aa  94  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  32.95 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  32.46 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 		 216 aa  88.2  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  33.63 
 
 		 216 aa  88.2  8e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  36.07 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  30.7 
 
 		 210 aa  84.7  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  30.9 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  30.8 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  40.91 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  30.25 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  29.05 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  30.08 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  28.94 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6259  Radical SAM domain protein  33.15 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  29.22 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  30.36 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  29.36 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  31.64 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  31.64 
 
 		 251 aa  72  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  30.17 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  29.48 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0220  hypothetical protein  24.46 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  27.96 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  23.55 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  33.33 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  29.44 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  28.89 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  28.89 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  28.89 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  28.89 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  28.89 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  28.89 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>