213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01548 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  100 
 
 		 412 aa  797    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  51.06 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  49.11 
 
 		 420 aa  280  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  43.28 
 
 		 447 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  42.65 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 427 aa  246  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 412 aa  240  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  38.33 
 
 		 412 aa  239  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 415 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  38.08 
 
 		 412 aa  237  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 433 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 412 aa  233  5e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  36.91 
 
 		 411 aa  232  1e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 428 aa  222  9e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 444 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  30.97 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 409 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 		 417 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  35.63 
 
 		 432 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 		 432 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  41.48 
 
 		 471 aa  209  9e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  32.61 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  32.61 
 
 		 418 aa  206  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 446 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  35.5 
 
 		 430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 471 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  34.96 
 
 		 431 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  34.6 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  30.42 
 
 		 726 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 429 aa  188  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  39.5 
 
 		 443 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 454 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 432 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  32.99 
 
 		 404 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 416 aa  183  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  30.15 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  33.99 
 
 		 434 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  30.89 
 
 		 410 aa  179  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  33.99 
 
 		 434 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  36.93 
 
 		 438 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  35.98 
 
 		 427 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  36.93 
 
 		 438 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  35.31 
 
 		 444 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  33.74 
 
 		 465 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 443 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 418 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 446 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 473 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 421 aa  176  9e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 447 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 429 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 424 aa  173  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  34.42 
 
 		 520 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 481 aa  170  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  30.55 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 436 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  33.05 
 
 		 474 aa  167  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 713 aa  166  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 476 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 480 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 480 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 480 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 480 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 476 aa  162  9e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 459 aa  160  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 474 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  32.17 
 
 		 427 aa  160  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  30.52 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 474 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0101  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 426 aa  157  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  27.15 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 446 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 446 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 446 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  26.68 
 
 		 395 aa  150  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  26.43 
 
 		 395 aa  149  6e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  26.43 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 464 aa  146  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  33.72 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  26.63 
 
 		 398 aa  139  7e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0691  hypothetical protein  32.05 
 
 		 384 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  30.14 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  25.19 
 
 		 407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  27.01 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  27.01 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707303 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  27.01 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>