More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01486 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01486  siroheme synthase  100 
 
 		 326 aa  627  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.71 
 
 		 480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.37 
 
 		 472 aa  216  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.6 
 
 		 480 aa  215  8e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  45.11 
 
 		 489 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.62 
 
 		 473 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.51 
 
 		 476 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  42.11 
 
 		 462 aa  207  2e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  49.43 
 
 		 476 aa  206  3e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.81 
 
 		 478 aa  206  4e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  43.46 
 
 		 472 aa  203  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  43.46 
 
 		 472 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.46 
 
 		 472 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  37.43 
 
 		 459 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  43.45 
 
 		 472 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  37.3 
 
 		 459 aa  193  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  42.16 
 
 		 465 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  39.22 
 
 		 458 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  41.83 
 
 		 465 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  40.52 
 
 		 457 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.57 
 
 		 528 aa  185  7e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  40.15 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  43.02 
 
 		 493 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  40.15 
 
 		 457 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  40.15 
 
 		 457 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.15 
 
 		 457 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  40.15 
 
 		 457 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  40.15 
 
 		 457 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  38.51 
 
 		 554 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  40.15 
 
 		 457 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  40.15 
 
 		 457 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.85 
 
 		 464 aa  182  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  39.03 
 
 		 457 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  37.86 
 
 		 473 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.49 
 
 		 487 aa  181  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  38.95 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  37.86 
 
 		 473 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.56 
 
 		 482 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  38.58 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  38.58 
 
 		 459 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  38.58 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  38.58 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  39.85 
 
 		 468 aa  180  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.55 
 
 		 502 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  41.83 
 
 		 462 aa  179  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.83 
 
 		 479 aa  179  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.5 
 
 		 464 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  37.54 
 
 		 470 aa  176  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  39.54 
 
 		 464 aa  175  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  33.75 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  39.74 
 
 		 464 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  36.7 
 
 		 467 aa  169  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.18 
 
 		 464 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.29 
 
 		 462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  34.83 
 
 		 314 aa  166  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.81 
 
 		 463 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.21 
 
 		 463 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.3 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.21 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  39.23 
 
 		 474 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.51 
 
 		 484 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  34.67 
 
 		 312 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  38.58 
 
 		 479 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  37.01 
 
 		 481 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1775  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  37.66 
 
 		 473 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0534697  normal  0.7368 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1933  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.74 
 
 		 495 aa  149  8e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6982  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  39.57 
 
 		 476 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1379  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.68 
 
 		 478 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.97 
 
 		 473 aa  144  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.95 
 
 		 470 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4696  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.77 
 
 		 478 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3562  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.71 
 
 		 478 aa  142  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1099  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 		 484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.656193 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  31.69 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  32.51 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  35.76 
 
 		 480 aa  139  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0569779  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1823  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.63 
 
 		 478 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.1629  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4015  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.82 
 
 		 480 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  33.21 
 
 		 306 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2762  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.71 
 
 		 476 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1636  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.03 
 
 		 478 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0591457  normal  0.234749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1399  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.73 
 
 		 478 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.58 
 
 		 467 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114628  normal  0.960594 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  39.9 
 
 		 213 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1671  siroheme synthase  36.69 
 
 		 464 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105367  normal  0.362016 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1155  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.56 
 
 		 461 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2187  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  35.06 
 
 		 303 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312119 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4522  siroheme synthase  33.96 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  35.82 
 
 		 213 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  33.18 
 
 		 225 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2146  siroheme synthase  30.33 
 
 		 485 aa  122  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529421  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  32.96 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  38.42 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1933  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.45 
 
 		 499 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.287576  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  35.36 
 
 		 212 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0267  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.96 
 
 		 521 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  34.67 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  31.21 
 
 		 303 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2296  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.87 
 
 		 490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  32.63 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>