More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01388 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1908  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.2 
 
 
795 aa  654    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00255913  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2470  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.06 
 
 
793 aa  666    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24212  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2469  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.65 
 
 
795 aa  636    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0698  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  48.36 
 
 
791 aa  661    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155841  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2418  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.32 
 
 
795 aa  654    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000318266  hitchhiker  0.0000890505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2067  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.91 
 
 
795 aa  643    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223695  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1981  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.61 
 
 
792 aa  675    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134276  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2086  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.58 
 
 
795 aa  652    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2383  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.62 
 
 
792 aa  659    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295144  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2015  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  72.22 
 
 
792 aa  1153    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2167  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.73 
 
 
792 aa  663    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1410  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.4 
 
 
792 aa  656    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1145  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.62 
 
 
793 aa  669    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.158362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1936  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.93 
 
 
792 aa  651    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0927196  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1404  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  44.46 
 
 
795 aa  666    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3476  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.06 
 
 
793 aa  667    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698698 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2592  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  44.71 
 
 
794 aa  664    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0126631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2509  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.36 
 
 
792 aa  655    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1582  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.65 
 
 
816 aa  644    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3220  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.18 
 
 
793 aa  668    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1603  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.58 
 
 
795 aa  659    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.643795  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1804  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.99 
 
 
793 aa  655    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20470  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.87 
 
 
792 aa  649    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2800  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  75.88 
 
 
802 aa  1200    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1874  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.95 
 
 
795 aa  647    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000755096  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1473  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.4 
 
 
792 aa  655    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000187632  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2215  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.46 
 
 
795 aa  673    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.188862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1972  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.88 
 
 
793 aa  657    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.025038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3020  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.98 
 
 
796 aa  642    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1829  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.58 
 
 
795 aa  657    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000186413  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1809  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.7 
 
 
795 aa  654    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2168  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.7 
 
 
795 aa  654    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0570245  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0763  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  48.62 
 
 
797 aa  652    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1709  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.43 
 
 
795 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28710  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.36 
 
 
792 aa  655    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.458463  decreased coverage  0.000000000220958 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2094  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  72.35 
 
 
792 aa  1154    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0432  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.13 
 
 
792 aa  696    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2597  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.09 
 
 
795 aa  653    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0200655  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1455  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.54 
 
 
789 aa  662    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105434  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1864  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.7 
 
 
795 aa  651    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1901  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.32 
 
 
795 aa  654    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00294003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01388  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  100 
 
 
792 aa  1571    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.547763  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1952  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.58 
 
 
795 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2995  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.94 
 
 
807 aa  634  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0870176  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1825  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.58 
 
 
795 aa  633  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713489  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2765  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.01 
 
 
793 aa  633  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02445  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.75 
 
 
795 aa  633  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.202536  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.45 
 
 
795 aa  632  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00723547  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2638  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.76 
 
 
793 aa  631  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1717  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.45 
 
 
795 aa  632  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00142202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2494  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.83 
 
 
795 aa  629  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0476201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2056  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.57 
 
 
790 aa  622  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2672  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.42 
 
 
794 aa  621  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01682  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  43.07 
 
 
795 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0961927  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1929  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  43.07 
 
 
795 aa  615  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000518334  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1835  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.07 
 
 
795 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000347523  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1012  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  46.97 
 
 
781 aa  618  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0141167 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1956  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.45 
 
 
795 aa  615  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0844  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.38 
 
 
795 aa  617  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714216  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1433  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.95 
 
 
795 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.030197 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1932  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.07 
 
 
795 aa  615  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047761  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1793  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.07 
 
 
795 aa  615  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000955232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1466  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.07 
 
 
795 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1893  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.11 
 
 
795 aa  617  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1918  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.07 
 
 
795 aa  615  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.333448  normal  0.421493 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003705  phenylalanyl-tRNA synthetase beta chain  42.52 
 
 
801 aa  617  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.374236  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1449  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.07 
 
 
795 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01671  hypothetical protein  43.07 
 
 
795 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0686641  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2007  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.07 
 
 
795 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.693647 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1955  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.95 
 
 
795 aa  612  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.111711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2185  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.03 
 
 
795 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.861692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2149  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.26 
 
 
795 aa  615  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625217  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0492  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.62 
 
 
792 aa  615  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229173  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2048  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.58 
 
 
795 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1477  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.95 
 
 
795 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2431  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.07 
 
 
795 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175376  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1729  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.07 
 
 
795 aa  609  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1998  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  44.44 
 
 
784 aa  610  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109142  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1662  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  41.21 
 
 
793 aa  599  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02093  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.01 
 
 
806 aa  600  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1732  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.5 
 
 
795 aa  594  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00878056  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1091  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.68 
 
 
810 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.39692  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1534  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.68 
 
 
810 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.540635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1896  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.68 
 
 
810 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.963354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0198  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.68 
 
 
810 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0148461  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0968  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.68 
 
 
810 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1740  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.68 
 
 
810 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.218671  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1457  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.42 
 
 
809 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2590  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.68 
 
 
810 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0998  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.42 
 
 
809 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1717  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.56 
 
 
810 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1480  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.42 
 
 
809 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1553  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.19 
 
 
810 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2751  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.14 
 
 
811 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0848577  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.18 
 
 
809 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.52188  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1774  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.75 
 
 
809 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.35718 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0917  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  44.72 
 
 
786 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1376  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.26 
 
 
811 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1404  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.56 
 
 
809 aa  571  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1364  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.68 
 
 
809 aa  571  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>