More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01386 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  100 
 
 
119 aa  231  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2802  50S ribosomal protein L20  99.16 
 
 
119 aa  229  9e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2096  50S ribosomal protein L20  93.28 
 
 
119 aa  220  4e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  92.44 
 
 
119 aa  219  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  72.88 
 
 
118 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  75.42 
 
 
118 aa  170  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  73.73 
 
 
118 aa  167  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  73.73 
 
 
118 aa  167  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  73.73 
 
 
118 aa  167  4e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  73.73 
 
 
118 aa  167  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2300  50S ribosomal protein L20  73.73 
 
 
118 aa  167  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000821818  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  73.28 
 
 
117 aa  166  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  73.73 
 
 
118 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  73.73 
 
 
118 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  72.88 
 
 
118 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  72.88 
 
 
118 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  72.88 
 
 
118 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  72.88 
 
 
118 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  72.03 
 
 
118 aa  164  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 
119 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  73.5 
 
 
117 aa  163  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 
118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  71.19 
 
 
118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  71.79 
 
 
119 aa  161  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  71.79 
 
 
119 aa  161  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  69.75 
 
 
119 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  71.19 
 
 
119 aa  161  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 
118 aa  161  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  71.19 
 
 
119 aa  161  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  70.59 
 
 
119 aa  160  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  71.79 
 
 
119 aa  159  9e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  70.34 
 
 
119 aa  158  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  70.94 
 
 
117 aa  158  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  70.34 
 
 
118 aa  159  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  70.94 
 
 
117 aa  158  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  70.94 
 
 
118 aa  157  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  70.94 
 
 
118 aa  157  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  70.94 
 
 
118 aa  157  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  70.94 
 
 
118 aa  157  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  70.94 
 
 
118 aa  157  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  70.94 
 
 
118 aa  157  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  70.94 
 
 
118 aa  157  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  70.94 
 
 
118 aa  157  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  70.94 
 
 
118 aa  157  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  70.94 
 
 
118 aa  157  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  70.09 
 
 
119 aa  157  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  68.91 
 
 
119 aa  153  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  67.52 
 
 
117 aa  152  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  67.24 
 
 
117 aa  151  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0430  ribosomal protein L20  64.41 
 
 
119 aa  152  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  67.8 
 
 
119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  69.57 
 
 
115 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  65.55 
 
 
119 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2906  50S ribosomal protein L20  71.43 
 
 
119 aa  148  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499167  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 
118 aa  148  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02482  50S ribosomal protein L20  71.19 
 
 
118 aa  148  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0118803  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  64.71 
 
 
119 aa  148  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0469  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 
120 aa  147  3e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.667366  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  64.71 
 
 
119 aa  148  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 
117 aa  147  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  63.87 
 
 
119 aa  147  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2767  50S ribosomal protein L20  70.75 
 
 
119 aa  147  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2640  50S ribosomal protein L20  70.75 
 
 
119 aa  147  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  63.03 
 
 
119 aa  147  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2147  ribosomal protein L20  72.88 
 
 
118 aa  147  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00368004  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1873  50S ribosomal protein L20  64.71 
 
 
119 aa  147  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.855478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2622  50S ribosomal protein L20  72.88 
 
 
118 aa  147  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000215786  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1823  50S ribosomal protein L20  72.88 
 
 
118 aa  147  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000424012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1715  50S ribosomal protein L20  72.88 
 
 
118 aa  147  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000852316  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01685  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0124084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1926  ribosomal protein L20  72.03 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000881806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1464  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.41069  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1475  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00112766  normal  0.994908 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2434  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000769531  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2009  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.824907 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1935  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000633644  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1916  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0615082  normal  0.489101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1431  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00452751  normal  0.0170461 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01674  hypothetical protein  72.03 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0196333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  59.66 
 
 
125 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1954  ribosomal protein L20  72.03 
 
 
118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.228066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1797  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588806  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1447  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135033  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1837  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264555  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1958  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000226645  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  61.54 
 
 
118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  59.66 
 
 
125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2183  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 
118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0855617  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  64.71 
 
 
119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1891  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 
118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2050  ribosomal protein L20  72.03 
 
 
118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0834597  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 
119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1727  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 
118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.080214  normal  0.49225 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  64.71 
 
 
119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  63.03 
 
 
120 aa  144  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
118 aa  144  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  63.87 
 
 
119 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  63.03 
 
 
119 aa  144  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1757  50S ribosomal protein L20  71.7 
 
 
117 aa  144  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0134124  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  63.03 
 
 
119 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>