More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01306 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01306  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 86 aa  174  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.154774  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2812  30S ribosomal protein S15  94.19 
 
 		 86 aa  165  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0206  30S ribosomal protein S15  89.53 
 
 		 86 aa  157  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0182  30S ribosomal protein S15  88.37 
 
 		 86 aa  155  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  72.84 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  71.43 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  71.43 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  71.43 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  71.43 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  71.43 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  71.43 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  71.43 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  71.43 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3515  30S ribosomal protein S15  73.75 
 
 		 88 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1056  30S ribosomal protein S15  70.24 
 
 		 89 aa  124  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1258  30S ribosomal protein S15  73.75 
 
 		 88 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142171 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  70.24 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  70.24 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  70.24 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  70.24 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2818  30S ribosomal protein S15  72.5 
 
 		 88 aa  121  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.219702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  70.24 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  70.24 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  70.24 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  70.24 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1897  30S ribosomal protein S15  69.05 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.320723  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2220  30S ribosomal protein S15  69.05 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5185  30S ribosomal protein S15  72.5 
 
 		 88 aa  120  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1398  SSU ribosomal protein S15P  66.67 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129269  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0952  30S ribosomal protein S15  72.5 
 
 		 88 aa  120  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000371083 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  119  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0867  30S ribosomal protein S15  72.5 
 
 		 88 aa  120  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.350166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1488  30S ribosomal protein S15  73.42 
 
 		 88 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  70 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0816  30S ribosomal protein S15  67.86 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  68.18 
 
 		 90 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  68.18 
 
 		 90 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1496  ribosomal protein S15  65.48 
 
 		 87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211437 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  70.37 
 
 		 88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  63.86 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0728  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  68.97 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1419  30S ribosomal protein S15  70 
 
 		 88 aa  116  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22503  normal  0.956384 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  69.14 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  72.15 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  69.14 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  69.14 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1006  ribosomal protein S15  67.09 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.148359  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  64.04 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  69.62 
 
 		 88 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  70.37 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3261  30S ribosomal protein S15  67.5 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0163  30S ribosomal protein S15  65.88 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  69.14 
 
 		 88 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  67.09 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3461  30S ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.22404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  68.29 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0588  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258599  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  65.48 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0782  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00988358  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3639  30S ribosomal protein S15  67.07 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4485  30S ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3577  30S ribosomal protein S15  67.07 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3540  30S ribosomal protein S15  67.07 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3471  30S ribosomal protein S15  67.07 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3471  30S ribosomal protein S15  67.07 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  65 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0492  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.156818  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0724  30S ribosomal protein S15  66.25 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0155068 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  69.05 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3996  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.842941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4709  30S ribosomal protein S15  66.25 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217974  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3727  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0997242  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3593  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.113046  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  68.35 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4709  30S ribosomal protein S15  65 
 
 		 89 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4574  30S ribosomal protein S15  65 
 
 		 89 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0323645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2705  30S ribosomal protein S15  61.18 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0076009  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  65.82 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0811  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  62.35 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  64.2 
 
 		 88 aa  110  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  65.43 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0073  30S ribosomal protein S15  63.53 
 
 		 88 aa  110  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0604  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4177  30S ribosomal protein S15  65 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3343  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.644233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>