197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01229 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  100 
 
 
427 aa  838    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  73.29 
 
 
426 aa  612  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  73.29 
 
 
426 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  75.24 
 
 
437 aa  599  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  54.43 
 
 
415 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  52.32 
 
 
436 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  54.37 
 
 
415 aa  411  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  51.43 
 
 
435 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  50.95 
 
 
424 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  51.18 
 
 
415 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  50 
 
 
425 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  52.45 
 
 
421 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  52.37 
 
 
424 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  50.97 
 
 
423 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  51.1 
 
 
431 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  53.25 
 
 
389 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  52.06 
 
 
410 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  50.97 
 
 
423 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  49.51 
 
 
435 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  50.48 
 
 
420 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  50.86 
 
 
431 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  50.97 
 
 
423 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  50.25 
 
 
423 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  50.25 
 
 
423 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  50.86 
 
 
431 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  50.25 
 
 
423 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  52.06 
 
 
421 aa  385  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  50.25 
 
 
423 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  50.49 
 
 
423 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  49.41 
 
 
407 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  47.48 
 
 
428 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  50 
 
 
435 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  50 
 
 
436 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  48.77 
 
 
428 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  47.91 
 
 
428 aa  360  3e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  51.6 
 
 
413 aa  347  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  51.37 
 
 
412 aa  345  7e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  44.74 
 
 
403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  42.7 
 
 
468 aa  335  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  43.58 
 
 
440 aa  334  2e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  41.52 
 
 
432 aa  311  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  44.83 
 
 
429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  42.41 
 
 
471 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  42.51 
 
 
431 aa  305  7e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  41.09 
 
 
417 aa  301  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  44.36 
 
 
413 aa  299  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  44.31 
 
 
428 aa  297  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  39.85 
 
 
417 aa  296  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  44.98 
 
 
408 aa  295  9e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  44.74 
 
 
408 aa  292  9e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  41.94 
 
 
431 aa  286  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  46.53 
 
 
431 aa  286  5e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  45.37 
 
 
405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  40.64 
 
 
412 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  38.97 
 
 
417 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  37.53 
 
 
458 aa  274  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  40.05 
 
 
409 aa  274  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  38.74 
 
 
434 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  38.37 
 
 
439 aa  253  4.0000000000000004e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  47.4 
 
 
485 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  40.48 
 
 
433 aa  252  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  39.7 
 
 
411 aa  250  4e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  37.07 
 
 
438 aa  247  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  37.07 
 
 
438 aa  247  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  37.07 
 
 
438 aa  247  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  37.07 
 
 
438 aa  247  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  37.07 
 
 
438 aa  246  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  36.83 
 
 
438 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  36.59 
 
 
438 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  36.59 
 
 
438 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  36.59 
 
 
438 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  36.59 
 
 
438 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  36.59 
 
 
438 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  34.87 
 
 
414 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  34.38 
 
 
434 aa  239  9e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  33.56 
 
 
425 aa  233  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  34.63 
 
 
443 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  33.99 
 
 
417 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  33.41 
 
 
412 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  33.09 
 
 
420 aa  226  9e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  34.39 
 
 
457 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  34.39 
 
 
457 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  34.7 
 
 
399 aa  224  3e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  34.94 
 
 
418 aa  223  4e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  34.15 
 
 
457 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  34.7 
 
 
418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  34.28 
 
 
419 aa  221  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  35.97 
 
 
421 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  33.66 
 
 
457 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  33.75 
 
 
448 aa  219  8.999999999999998e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  40.44 
 
 
426 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03600  L-fucose: permease  37.41 
 
 
442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  31.77 
 
 
413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1614  fucose permease  33.09 
 
 
448 aa  211  2e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139111  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  34.33 
 
 
432 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01616  putative fucose permease  36.24 
 
 
381 aa  210  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000108257  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  34.1 
 
 
432 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  34.56 
 
 
432 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  33.87 
 
 
432 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  33.87 
 
 
432 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>