231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01172 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  100 
 
 		 220 aa  454  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  77.07 
 
 		 221 aa  334  5.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  80 
 
 		 204 aa  317  7.999999999999999e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  79.35 
 
 		 186 aa  312  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  57.06 
 
 		 184 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  57.06 
 
 		 184 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  52.46 
 
 		 185 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  51.91 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  50 
 
 		 189 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  49.18 
 
 		 189 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  52.02 
 
 		 181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  47.54 
 
 		 189 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  45.7 
 
 		 196 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0267  HNH endonuclease domain-containing protein  48.9 
 
 		 194 aa  178  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3847  HNH endonuclease  45.9 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3227  HNH endonuclease  46.99 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  46.99 
 
 		 185 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  46.35 
 
 		 193 aa  175  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  45.36 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  46.45 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  46.45 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  45.9 
 
 		 185 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  45.36 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  43.92 
 
 		 194 aa  169  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  45.7 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  45.76 
 
 		 193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  45.05 
 
 		 187 aa  157  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  46.86 
 
 		 184 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  44.51 
 
 		 202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  41.85 
 
 		 187 aa  145  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  44.13 
 
 		 191 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  50 
 
 		 174 aa  96.3  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  34.78 
 
 		 197 aa  95.1  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  34.78 
 
 		 168 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  54.67 
 
 		 168 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  54.67 
 
 		 168 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  52.56 
 
 		 198 aa  93.2  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  36.84 
 
 		 174 aa  92  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  51.85 
 
 		 166 aa  91.7  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  50.65 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  46.75 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  50.65 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  44.66 
 
 		 183 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  50.65 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  43.69 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  50.65 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  44 
 
 		 182 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  44 
 
 		 182 aa  89  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  44 
 
 		 182 aa  89  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  50 
 
 		 179 aa  89  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  48.1 
 
 		 169 aa  88.6  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  52.11 
 
 		 205 aa  88.2  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  33.95 
 
 		 169 aa  88.2  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  44.12 
 
 		 182 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  52 
 
 		 168 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  48.89 
 
 		 171 aa  87.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  49.33 
 
 		 165 aa  86.3  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  36.6 
 
 		 174 aa  86.3  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  34.9 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  34.23 
 
 		 185 aa  85.1  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  46 
 
 		 188 aa  84.7  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  45.63 
 
 		 189 aa  84.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  50.67 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  50.67 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  52 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  34.9 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  50.63 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  57.75 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  34.9 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  49.37 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  35.67 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  35.37 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  39.58 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  48 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  52 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  43.43 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  32.89 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  50.67 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  49.33 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  40.2 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  39.58 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  47.44 
 
 		 169 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 172 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17680  restriction endonuclease  45.12 
 
 		 175 aa  77.8  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  45.68 
 
 		 146 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  36 
 
 		 167 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  48.72 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  47.44 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  36.64 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  32.03 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  47.44 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  48.72 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 186 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  48.72 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  48.72 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>