More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01156 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01156  multidrug resistance efflux pump  100 
 
 
372 aa  743    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1288  secretion protein HlyD family protein  78.47 
 
 
392 aa  539  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  64.1 
 
 
400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  63.82 
 
 
394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  60.06 
 
 
397 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  59.77 
 
 
397 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  57.46 
 
 
402 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  57.46 
 
 
402 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2373  secretion protein HlyD family protein  60.63 
 
 
395 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3643  secretion protein HlyD  58.15 
 
 
400 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870857  normal  0.0330116 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2078  secretion protein HlyD family protein  59.77 
 
 
397 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4889  HlyD family secretion protein  56.07 
 
 
459 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.392756  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2468  secretion protein HlyD family protein  54.25 
 
 
393 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1634  secretion protein HlyD family protein  55.87 
 
 
453 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.975133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  54.99 
 
 
404 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  54.99 
 
 
404 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  54.99 
 
 
404 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  53.3 
 
 
406 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  54.13 
 
 
410 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3583  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  54.42 
 
 
420 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0766049  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1636  efflux pump membrane protein  54.97 
 
 
424 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00067211 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  54.13 
 
 
411 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1057  multidrug resistance protein, putative  54.13 
 
 
411 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0394345  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  54.91 
 
 
407 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  54.42 
 
 
411 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  54.13 
 
 
411 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  53.61 
 
 
404 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  54.13 
 
 
411 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  54.42 
 
 
411 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2816  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  54.42 
 
 
413 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106074  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  54.42 
 
 
411 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  54.6 
 
 
407 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  54.6 
 
 
405 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  51.82 
 
 
413 aa  362  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2021  secretion protein HlyD family protein  51.01 
 
 
413 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4314  MFS efflux pump, membrane fusion protein, EmrA subfamily  52.03 
 
 
423 aa  358  7e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1293  multidrug resistance A (translocase) transmembrane protein  51.66 
 
 
428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.538155  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1214  secretion protein HlyD family protein  50.83 
 
 
429 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.314397  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1123  secretion protein HlyD family protein  50.83 
 
 
429 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.911317  normal  0.519674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2024  secretion protein HlyD  51.26 
 
 
429 aa  349  6e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0436308  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0262  secretion protein HlyD family protein  52.25 
 
 
405 aa  341  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123427 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4021  secretion protein HlyD family protein  49.87 
 
 
451 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0257  secretion protein HlyD family protein  52.25 
 
 
402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2416  secretion protein HlyD family protein  48.66 
 
 
437 aa  339  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.975538 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1445  secretion protein HlyD family protein  48.94 
 
 
444 aa  338  8e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  48.01 
 
 
405 aa  333  4e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6205  secretion protein HlyD  50.86 
 
 
450 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127149  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3490  secretion protein HlyD family protein  49.6 
 
 
448 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0859  secretion protein HlyD  48.91 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556695  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3235  secretion protein HlyD  49.2 
 
 
465 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.265062  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5574  secretion protein HlyD family protein  50.86 
 
 
480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  44.57 
 
 
391 aa  323  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  44.57 
 
 
391 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  43.53 
 
 
380 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  44.51 
 
 
390 aa  316  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  44.51 
 
 
390 aa  316  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3743  efflux pump membrane protein  43.92 
 
 
390 aa  315  6e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  44.51 
 
 
390 aa  315  8e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0460  multidrug resistance protein  44.57 
 
 
403 aa  315  8e-85  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3743  secretion protein HlyD family protein  47.18 
 
 
453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00143217  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0858  efflux pump membrane protein  44.66 
 
 
391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0890  efflux pump membrane protein  46.18 
 
 
391 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0249504  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02540  multidrug efflux system  45.65 
 
 
390 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02505  hypothetical protein  45.65 
 
 
390 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2821  multidrug resistance protein A  45.65 
 
 
390 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2807  multidrug resistance protein A  45.65 
 
 
390 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000414824  hitchhiker  0.00826621 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1022  efflux pump membrane protein  45.65 
 
 
390 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.727271  normal  0.0227655 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2968  multidrug resistance protein A  45.65 
 
 
390 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0999  efflux pump membrane protein  45.35 
 
 
390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.486081  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3163  efflux pump membrane protein  42.86 
 
 
390 aa  301  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3930  multidrug resistance protein A  45.35 
 
 
394 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.725166 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2931  multidrug resistance protein A  44.41 
 
 
390 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2962  multidrug resistance protein A  44.41 
 
 
390 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  hitchhiker  0.00715907 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3120  multidrug resistance protein A  44.41 
 
 
390 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0308659 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3014  multidrug resistance protein A  44.41 
 
 
390 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193784 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2997  multidrug resistance protein A  44.41 
 
 
390 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3191  multidrug resistance protein A  45.05 
 
 
390 aa  297  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.168067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3599  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  43.03 
 
 
387 aa  278  8e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0273562 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02278  EmrKY-TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component  42.73 
 
 
387 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.29421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1289  efflux pump membrane protein  42.73 
 
 
387 aa  278  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2518  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  42.73 
 
 
387 aa  278  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2505  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  42.73 
 
 
387 aa  278  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.012377  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1301  efflux pump membrane protein  42.73 
 
 
387 aa  278  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.632829  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02239  hypothetical protein  42.73 
 
 
387 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2737  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  42.42 
 
 
387 aa  276  4e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.778541  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2654  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  42.42 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0732  multidrug resistance secretion protein  48.33 
 
 
489 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2100  multidrug resistance protein  48.33 
 
 
489 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1825  multidrug resistance protein  48.33 
 
 
489 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.996701  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0368  multidrug resistance protein  48.33 
 
 
489 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0818  multidrug resistance secretion protein  48.33 
 
 
489 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388202  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1416  multidrug resistance protein  48.33 
 
 
457 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304514  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0456  multidrug resistance protein  48.33 
 
 
457 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0717  putative multidrug resistance protein  48.33 
 
 
457 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.053035  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1987  putative multidrug resistance protein  48.33 
 
 
457 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0847932  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0925  multidrug resistance protein  48.33 
 
 
417 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1013  putative multidrug resistance protein  48.33 
 
 
417 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1914  multidrug resistance efflux pump  48.33 
 
 
417 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0192  multidrug resistance protein A  48.33 
 
 
417 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0464  putative multidrug resistance protein  48.33 
 
 
388 aa  258  8e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>