90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01137 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01137  pili assembly chaperone  100 
 
 		 235 aa  474  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0327551  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1271  pili assembly chaperone  49.78 
 
 		 244 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1922  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  43.83 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1830  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  46.73 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1801  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  39.06 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.109168  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3334  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  38.63 
 
 		 258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1269  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  38.25 
 
 		 243 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0558339  normal  0.0398715 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4396  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  40.38 
 
 		 239 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2361  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  38.63 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200412  normal  0.497633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1447  putative fimbrial chaperone  34.08 
 
 		 260 aa  138  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1961  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  36.96 
 
 		 258 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4601  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  32.79 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2818  putative fimbrial chaperone  32.88 
 
 		 257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4689  putataive fimbrial chaperone protein  37.06 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61530  putative pili assembly chaperone  38.39 
 
 		 262 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.223638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5300  putative pili assembly chaperone  36.67 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2460  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  35.78 
 
 		 253 aa  128  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1635  fimbrial chaperone protein  35.5 
 
 		 279 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1613  type I pilus usher pathway chaperone CsuC  35.5 
 
 		 279 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1792  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  35.5 
 
 		 279 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0680  putative fimbrial assembly chaperone  35.06 
 
 		 279 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902912  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0875  fimbrial assembly chaperone, putative  35.06 
 
 		 279 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0478  putative fimbrial assembly chaperone  35.06 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.621456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1398  putative fimbrial assembly chaperone  35.06 
 
 		 279 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2109  putative chaperone protein  33.9 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024073 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1063  P pilus assembly protein, chaperone PapD  36.79 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1606  hypothetical protein  36.27 
 
 		 236 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2293  hypothetical protein  36.27 
 
 		 236 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0722  hypothetical protein  36.27 
 
 		 236 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278946  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2993  hypothetical protein  36.27 
 
 		 236 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.810791  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1222  hypothetical protein  36.27 
 
 		 236 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0849986  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3670  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  33.48 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2678  fimbrial assembly chaperone, putative  32.89 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1070  putative pilus assembly chaperone  36.27 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01133  pili assembly chaperone  36.57 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0694484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0866  hypothetical protein  36.27 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391209  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5758  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  37.23 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2474  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  36.17 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1267  pili assembly chaperone  35.32 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.475835 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2340  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  36.17 
 
 		 237 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.200473 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1664  pilus assembly chaperone  32.49 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2670  pilus assembly chaperone  32.49 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0194825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1775  chaperone protein  32.49 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241363  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001217  pilus assembly protein chaperone PapD  30.54 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0779  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  37.11 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.765293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0007  chaperone protein EcpD  33.94 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00437464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0006  pilus chaperone protein, putative  33.94 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0451749  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03042  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  34.78 
 
 		 241 aa  104  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168941  normal  0.259112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2694  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  36.5 
 
 		 253 aa  101  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5510  putative fimbrial chaperone protein  31.79 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2058  putative P pilus assembly protein, chaperone PapD  29.47 
 
 		 263 aa  85.5  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.62462e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0343  putative pilus assembly protein chaperone PapD  26.94 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0611  chaperone protein PmfD, putative  27.32 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000224808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0536  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  30.46 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0305  chaperone protein pmfD, putative  26.56 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0145  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  29.85 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  30.24 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  26.73 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3666  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  27.75 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.486976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  25 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3600  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  27.46 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  27.13 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  25.79 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.33 
 
 		 247 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1317  fimbral chaperone protein  27.43 
 
 		 260 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.33 
 
 		 247 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  25.66 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  26.11 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  25.66 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3741  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  27.98 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03366  hypothetical protein  21.67 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  24.78 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  25.66 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  24.78 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  25.48 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  25.48 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  25.96 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  25.48 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  23.56 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  26.4 
 
 		 227 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  25.6 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  25.81 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  25.83 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  25.62 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  24.86 
 
 		 309 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4981  putative periplasmic chaperone protein  26.24 
 
 		 235 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  24.86 
 
 		 267 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  24.86 
 
 		 267 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  24.86 
 
 		 253 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  24.86 
 
 		 309 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>