More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00880 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  100 
 
 		 440 aa  908    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  76.09 
 
 		 430 aa  645    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  76.09 
 
 		 430 aa  646    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  71.6 
 
 		 446 aa  620  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1023  extracellular solute-binding protein  44 
 
 		 422 aa  352  8e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.705733  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  41.84 
 
 		 434 aa  319  7e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  31.55 
 
 		 424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 		 399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  33.76 
 
 		 427 aa  226  7e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  31.83 
 
 		 426 aa  219  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  30 
 
 		 428 aa  218  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 430 aa  146  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.22 
 
 		 426 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 429 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.37 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.38 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.2 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 486 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.94 
 
 		 410 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  28.02 
 
 		 419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 432 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 		 504 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 427 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 		 432 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.56 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 424 aa  108  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.33 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 413 aa  107  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 425 aa  106  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.68 
 
 		 422 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.93 
 
 		 430 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.88 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  26.88 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 459 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 421 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 411 aa  100  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  31.41 
 
 		 416 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 410 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 416 aa  98.2  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0069  twin-arginine translocation pathway signal  26.89 
 
 		 432 aa  97.4  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 		 415 aa  97.4  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 423 aa  96.3  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 419 aa  94.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 419 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 428 aa  93.2  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 413 aa  92.8  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 410 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 		 424 aa  92.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 417 aa  90.9  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 435 aa  90.5  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  22.51 
 
 		 441 aa  89  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 420 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 443 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  22.36 
 
 		 410 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  28.4 
 
 		 445 aa  87  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  21.95 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 461 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.99 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2614  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000017055  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.48 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  24.21 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.57 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.57 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 488 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.57 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>