104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00878 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  39.98 
 
 		 1016 aa  658    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  40.45 
 
 		 1008 aa  673    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  40.49 
 
 		 1008 aa  662    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  100 
 
 		 992 aa  2042    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  44.36 
 
 		 1012 aa  744    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  42.28 
 
 		 1010 aa  721    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  43.76 
 
 		 1026 aa  722    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 1041 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  24.17 
 
 		 1007 aa  140  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1069 aa  137  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  35.46 
 
 		 1075 aa  137  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  23.91 
 
 		 986 aa  137  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  30.93 
 
 		 1052 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  23.94 
 
 		 1081 aa  123  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  23.98 
 
 		 1056 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 1114 aa  118  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  23.92 
 
 		 1097 aa  118  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1122 aa  118  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1125 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1066 aa  113  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1074 aa  111  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  23.52 
 
 		 1077 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 1105 aa  109  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 1007 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  22.78 
 
 		 1037 aa  108  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 1123 aa  107  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  23.01 
 
 		 1068 aa  106  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1071 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1071 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  30.41 
 
 		 1067 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 1149 aa  103  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  24 
 
 		 1061 aa  102  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 1232 aa  102  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1068 aa  102  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1162 aa  101  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  22.32 
 
 		 966 aa  99.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 1123 aa  99  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 1176 aa  98.6  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 1065 aa  98.2  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  29.43 
 
 		 511 aa  97.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  23.49 
 
 		 972 aa  96.3  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1141 aa  95.1  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 1206 aa  94.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  21.35 
 
 		 993 aa  94  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1257 aa  92.4  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  29.97 
 
 		 1075 aa  92.4  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  28.48 
 
 		 1195 aa  92.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1161 aa  91.7  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  23.84 
 
 		 1116 aa  90.5  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1053 aa  89.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  27.27 
 
 		 1203 aa  89  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  25.2 
 
 		 1057 aa  88.6  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  22.13 
 
 		 1066 aa  87.8  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 1066 aa  87.4  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  27.82 
 
 		 1194 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  23.82 
 
 		 1041 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1129 aa  87  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  23.31 
 
 		 979 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  21.78 
 
 		 1051 aa  85.5  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 1153 aa  85.9  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  24.42 
 
 		 1008 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  28.06 
 
 		 1298 aa  82.8  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.43 
 
 		 1050 aa  82.4  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  22.09 
 
 		 1007 aa  81.6  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3287  TonB-dependent receptor plug  22.77 
 
 		 856 aa  81.3  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550182  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 1167 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 1105 aa  79.3  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  22.41 
 
 		 1001 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1126 aa  77.8  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1132 aa  75.5  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  28.71 
 
 		 1173 aa  73.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1109 aa  73.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1120 aa  71.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1122 aa  71.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 1188 aa  71.2  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  21.53 
 
 		 1066 aa  69.7  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1008 aa  69.7  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  22.55 
 
 		 1100 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 1054 aa  68.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  24.17 
 
 		 1210 aa  68.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  26.67 
 
 		 1162 aa  68.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  21.8 
 
 		 997 aa  67  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1196 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 991 aa  66.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 1124 aa  63.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  21.47 
 
 		 1105 aa  63.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0997  TonB-dependent receptor plug  22.39 
 
 		 935 aa  62.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0760  TonB-dependent receptor plug  22.37 
 
 		 867 aa  59.7  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  21.43 
 
 		 994 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 1010 aa  56.2  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  22.32 
 
 		 1074 aa  55.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 805 aa  55.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  24.76 
 
 		 1125 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1194 aa  52  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 1004 aa  51.2  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2212  putative TonB dependent receptor  22.99 
 
 		 862 aa  49.7  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 753 aa  49.3  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 778 aa  48.9  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 865 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 730 aa  46.6  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>