More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00822 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00822  threonine synthase  100 
 
 
434 aa  861    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00943473  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1356  threonine synthase  77.67 
 
 
433 aa  615  1e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1423  threonine synthase  76.74 
 
 
433 aa  606  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1751  threonine synthase  75.76 
 
 
428 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.182156 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1096  threonine synthase  49.3 
 
 
432 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3806  threonine synthase  40.32 
 
 
435 aa  338  8e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0398302  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5522  threonine synthase  41.8 
 
 
435 aa  332  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000125532  normal  0.439141 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0138  threonine synthase  43.05 
 
 
439 aa  331  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2334  threonine synthase  42.33 
 
 
437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2546  threonine synthase  41.69 
 
 
438 aa  326  6e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.229703  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0260  threonine synthase  40.75 
 
 
438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0295  threonine synthase  41.61 
 
 
439 aa  313  4.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.212464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5431  threonine synthase  41.19 
 
 
435 aa  313  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418256  normal  0.890668 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0075  threonine synthase  39.12 
 
 
434 aa  313  5.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1987  threonine synthase  41.26 
 
 
438 aa  311  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2707  threonine synthase  40.42 
 
 
438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.207551  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4289  threonine synthase  39.68 
 
 
434 aa  303  5.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2402  threonine synthase  43.16 
 
 
432 aa  300  3e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1383  threonine synthase  38.46 
 
 
422 aa  296  5e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1613  threonine synthase  38.23 
 
 
424 aa  295  8e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1360  threonine synthase  43.71 
 
 
428 aa  295  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1263  threonine synthase  43.16 
 
 
436 aa  292  7e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004455  threonine synthase  40.71 
 
 
426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2573  threonine synthase  40.19 
 
 
429 aa  283  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.965745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3802  threonine synthase  37.39 
 
 
439 aa  282  8.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1277  threonine synthase  38.66 
 
 
425 aa  282  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.507773  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07410  threonine synthase  36.24 
 
 
453 aa  280  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00941  threonine synthase  40.71 
 
 
426 aa  280  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1212  threonine synthase  39.57 
 
 
425 aa  277  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.13484  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0806  threonine synthase  40.94 
 
 
426 aa  276  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3474  threonine synthase  40.94 
 
 
429 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3602  threonine synthase  40.94 
 
 
429 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1941  threonine synthase  39.29 
 
 
426 aa  272  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0392149  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2554  threonine synthase  39.34 
 
 
427 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3578  threonine synthase  36.11 
 
 
427 aa  272  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0685  threonine synthase  40.19 
 
 
429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0750067  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0535  threonine synthase  40.19 
 
 
429 aa  270  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0457  L-threonine synthase  36.77 
 
 
447 aa  267  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0566  threonine synthase  38.46 
 
 
428 aa  265  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03326  threonine synthase  37.02 
 
 
427 aa  264  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0907  threonine synthase  39.86 
 
 
428 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3592  threonine synthase  38.95 
 
 
428 aa  260  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1081  threonine synthase  38.05 
 
 
427 aa  260  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.301795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1068  threonine synthase  37.79 
 
 
428 aa  260  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00004  threonine synthase  38.95 
 
 
428 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.863935  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0004  threonine synthase  38.95 
 
 
428 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0003  threonine synthase  38.95 
 
 
428 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3651  threonine synthase  38.95 
 
 
428 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0005  threonine synthase  38.95 
 
 
428 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.674616  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00004  hypothetical protein  38.95 
 
 
428 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.902262  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0003  threonine synthase  38.95 
 
 
428 aa  259  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0574  threonine synthase  38.59 
 
 
429 aa  259  6e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1177  threonine synthase  37.91 
 
 
426 aa  259  8e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.300194  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0005  threonine synthase  38.72 
 
 
428 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.817747  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0004  threonine synthase  38.55 
 
 
428 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66148  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0004  threonine synthase  38.55 
 
 
428 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.153937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0004  threonine synthase  38.55 
 
 
428 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0004  threonine synthase  38.55 
 
 
428 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.70048  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0004  threonine synthase  38.55 
 
 
428 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2738  threonine synthase  38.06 
 
 
426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00144538  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2904  threonine synthase  37.59 
 
 
427 aa  254  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.869101  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3413  threonine synthase  38.84 
 
 
427 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1141  threonine synthase  38.76 
 
 
427 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212689  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1272  threonine synthase  37.36 
 
 
426 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3666  threonine synthase  39.06 
 
 
429 aa  252  9.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3861  threonine synthase  38.59 
 
 
429 aa  252  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1140  threonine synthase  38.6 
 
 
427 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1211  threonine synthase  38.76 
 
 
427 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  35.59 
 
 
469 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  35.59 
 
 
469 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  35.59 
 
 
469 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  35.59 
 
 
469 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  34.57 
 
 
469 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  34.13 
 
 
469 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1587  threonine synthase  35.11 
 
 
448 aa  242  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.34277  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  35.62 
 
 
463 aa  240  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3084  threonine synthase  37.53 
 
 
427 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  hitchhiker  0.00247535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1273  threonine synthase  37.53 
 
 
427 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  37.44 
 
 
465 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  34.06 
 
 
469 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1229  threonine synthase  37.53 
 
 
427 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2733  threonine synthase  36.78 
 
 
427 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  36.21 
 
 
470 aa  238  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  36.12 
 
 
465 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  36.32 
 
 
463 aa  237  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1306  threonine synthase  37.07 
 
 
427 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  36.32 
 
 
463 aa  237  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  36.67 
 
 
462 aa  235  9e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  35.09 
 
 
468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  35.06 
 
 
463 aa  233  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  33.55 
 
 
460 aa  232  9e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  35.81 
 
 
461 aa  230  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  35.89 
 
 
461 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  33.62 
 
 
472 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  35.67 
 
 
461 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  34.43 
 
 
462 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  35.03 
 
 
465 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  35.55 
 
 
473 aa  227  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  34.27 
 
 
469 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  35.06 
 
 
467 aa  226  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>