58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00630 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00630  hypothetical protein  100 
 
 
535 aa  1099  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0944683  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3757  hypothetical protein  48.59 
 
 
532 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  46.52 
 
 
533 aa  481  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2562  hypothetical protein  40.82 
 
 
541 aa  383  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  31.66 
 
 
522 aa  240  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  28.97 
 
 
520 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  25 
 
 
537 aa  132  2e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  27.14 
 
 
565 aa  87.8  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  27.03 
 
 
569 aa  79.3  2e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  27.03 
 
 
569 aa  79.3  2e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  24.39 
 
 
703 aa  52  3e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.08 
 
 
637 aa  50.8  6e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  24.66 
 
 
606 aa  50.8  6e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  25 
 
 
650 aa  50.4  8e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  40 
 
 
460 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  26.8 
 
 
688 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0011  recombination protein F  36.07 
 
 
359 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10983  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1095  hypothetical protein  38.67 
 
 
453 aa  49.3  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00653553  hitchhiker  0.00178411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  23.36 
 
 
610 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  24.35 
 
 
666 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  31.4 
 
 
461 aa  48.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  52.5 
 
 
358 aa  47.8  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  36 
 
 
353 aa  47.8  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0003  DNA replication and repair protein RecF  42 
 
 
350 aa  47.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00329262  decreased coverage  0.000397503 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0002  DNA replication and repair protein RecF  42 
 
 
350 aa  47.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.617644  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  25.31 
 
 
596 aa  47  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  42.86 
 
 
440 aa  47.4  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2505  recombination protein F  28.74 
 
 
363 aa  47  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0488541  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00444  recombination protein F  34.43 
 
 
357 aa  47  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0400  hypothetical protein  39.22 
 
 
758 aa  46.6  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000863332  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  44.68 
 
 
613 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  32.47 
 
 
623 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0384  hypothetical protein  39.22 
 
 
758 aa  46.6  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  3.55497e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002007  DNA recombination and repair protein RecF  32.79 
 
 
359 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0003677  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.84 
 
 
360 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0698954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  25.15 
 
 
712 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  33.8 
 
 
496 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3146  DNA replication and repair protein RecF  37.04 
 
 
403 aa  45.4  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.522741  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  32.69 
 
 
375 aa  44.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0043  DNA replication and repair protein RecF  36.54 
 
 
433 aa  44.3  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  24.72 
 
 
531 aa  44.3  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4151  recombination protein F  29.58 
 
 
361 aa  43.9  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000332755  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  29.41 
 
 
553 aa  43.9  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0138  recombination protein F  27.91 
 
 
358 aa  43.9  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0003  recombination protein F  29.58 
 
 
361 aa  43.9  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4175  recombination protein F  29.58 
 
 
361 aa  43.9  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0239408  normal  0.0132322 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0003  recombination protein F  30.99 
 
 
357 aa  43.9  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  7.48335e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11501  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  31.43 
 
 
542 aa  43.9  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.126079 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  28.16 
 
 
762 aa  43.9  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  40.74 
 
 
369 aa  43.5  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4121  recombination protein F  30.99 
 
 
357 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.976477  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4170  recombination protein F  30.99 
 
 
357 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  normal  0.357156 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  37.25 
 
 
406 aa  43.5  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  32 
 
 
634 aa  43.5  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  38.3 
 
 
564 aa  43.5  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4048  recombination protein F  30.99 
 
 
357 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331316  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4064  recombination protein F  30.99 
 
 
357 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4228  recombination protein F  30.99 
 
 
357 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>