More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00589 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  100 
 
 
154 aa  306  4e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  88.24 
 
 
140 aa  243  4.9999999999999997e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  81.94 
 
 
145 aa  243  9e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  81.94 
 
 
145 aa  243  9e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.52 
 
 
141 aa  107  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 
141 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.28 
 
 
140 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14750  Biopolymer transport protein ExbD  41.35 
 
 
142 aa  103  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.44 
 
 
137 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2091  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35 
 
 
140 aa  100  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0833564  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  38.46 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0632  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.31 
 
 
141 aa  97.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  40.15 
 
 
146 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1613  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.84 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.921592  normal  0.194939 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.04 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  40.62 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.33 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000374903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1634  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.3 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0335583  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.48 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2304  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.57 
 
 
141 aa  92  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0677093  normal  0.134165 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2642  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.3 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1555  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.57 
 
 
141 aa  92  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.07 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3571  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.81 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161015  decreased coverage  0.00354496 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.33 
 
 
140 aa  90.5  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0536  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.23 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000196939  hitchhiker  0.000000905807 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2565  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.57 
 
 
141 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  hitchhiker  0.00490818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3846  biopolymer transport protein ExbD/TolR family  35.62 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.661546  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.76 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.5 
 
 
143 aa  88.2  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395657  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4892  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.310639 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2554  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.86 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133317 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1509  biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  35.07 
 
 
138 aa  87.4  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.171101  normal  0.278773 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.96 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.33 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.03 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0584856  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2948  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1924  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.68 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  35.29 
 
 
143 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.35 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.59 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  33.59 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2484  putative biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  32.81 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0200822  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0313  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.6 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.01 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0285  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.09 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  35.48 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0581  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.87 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000412701  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1510  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.76 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43562  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.86 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1899  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000511207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3815  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.06 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446813  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  29.37 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.15 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  26.92 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1317  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.15 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.893415  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  31.87 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.08 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  33.6 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.15 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0605408  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.51 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.22 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5006  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.75 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.108407 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1715  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.21 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.08 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6363  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.21 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0283531  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.99 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1730  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.21 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245052  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3669  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.4 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  28.87 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.84 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  28.23 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.05 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.203844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  30 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.68 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4033  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.92 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1241  TonB system transport protein ExbD  28.93 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.977225  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.23 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.03 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.03 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.03 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.33 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  28.99 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.81 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.94 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.6 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0438  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.29 
 
 
137 aa  63.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.744335  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0105  TonB system transport protein ExbD, putative  30.77 
 
 
129 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.664696  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.29 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  25.74 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.2 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  29.6 
 
 
139 aa  62.8  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  30.26 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0145  TonB system transport protein ExbD, putative  30.77 
 
 
129 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057869  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.03 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0117  TonB system transport protein ExbD, putative  30 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000384782  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0690  biopolymer transport protein  28.68 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0276966  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.29 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>