161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00583 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  944    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  67.09 
 
 
470 aa  607  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.19 
 
 
493 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  30.74 
 
 
503 aa  233  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  31.78 
 
 
581 aa  223  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  32.62 
 
 
498 aa  210  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  30.41 
 
 
504 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  33.27 
 
 
487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.32 
 
 
639 aa  168  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32 
 
 
641 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.71 
 
 
612 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.24 
 
 
612 aa  153  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  32.57 
 
 
697 aa  152  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.74 
 
 
628 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  30.66 
 
 
644 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.72 
 
 
612 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  30.45 
 
 
634 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  28.95 
 
 
672 aa  136  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  28.92 
 
 
674 aa  134  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.41 
 
 
688 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  33.02 
 
 
584 aa  130  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  29.49 
 
 
699 aa  129  9.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  32.18 
 
 
652 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30.99 
 
 
1750 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6443  NHL repeat containing protein  31.65 
 
 
344 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  30.45 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  29.59 
 
 
1051 aa  81.3  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  33.19 
 
 
2296 aa  80.1  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  26.47 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  29.57 
 
 
623 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  26.11 
 
 
963 aa  75.1  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.33 
 
 
1292 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.91 
 
 
693 aa  73.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  29.23 
 
 
1351 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.5 
 
 
1130 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  34.17 
 
 
581 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  27.37 
 
 
425 aa  70.1  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  27.22 
 
 
1030 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  30.65 
 
 
439 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0817  redoxin domain-containing protein  27.65 
 
 
369 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 
850 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.17 
 
 
623 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  28.35 
 
 
591 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.17 
 
 
622 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.17 
 
 
625 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.62 
 
 
626 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.77 
 
 
576 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.56 
 
 
596 aa  67  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  30.8 
 
 
772 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  28.57 
 
 
1293 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.25 
 
 
609 aa  66.6  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  30.43 
 
 
622 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.3 
 
 
619 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.3 
 
 
619 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  31.3 
 
 
604 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  27.59 
 
 
186 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  28.91 
 
 
193 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  28.35 
 
 
592 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.92 
 
 
200 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.3 
 
 
619 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  29.23 
 
 
197 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  31.36 
 
 
695 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.57 
 
 
596 aa  65.1  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  29.23 
 
 
197 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.91 
 
 
589 aa  65.1  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  23.45 
 
 
676 aa  64.7  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  25.29 
 
 
522 aa  64.7  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.59 
 
 
403 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.03 
 
 
589 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  30.36 
 
 
1026 aa  64.3  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  29.57 
 
 
691 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  28.7 
 
 
188 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  30.43 
 
 
469 aa  63.9  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0074  thioredoxin-like protein  31.3 
 
 
381 aa  63.9  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246531  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  30.77 
 
 
193 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 
892 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  28.7 
 
 
189 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2329  NHL repeat containing protein  35.29 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716797  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  28.52 
 
 
719 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  28.96 
 
 
646 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  25.71 
 
 
831 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  29.36 
 
 
193 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  29.36 
 
 
193 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  28.44 
 
 
193 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  26.96 
 
 
589 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.72 
 
 
404 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0890  hypothetical protein  23.2 
 
 
310 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3754  NHL repeat containing protein  27.53 
 
 
398 aa  61.2  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  27.11 
 
 
930 aa  61.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13808  predicted protein  24.53 
 
 
1675 aa  60.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0947447  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0477  NHL repeat containing protein  27.87 
 
 
368 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.517472  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  25.2 
 
 
187 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.83 
 
 
598 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  25.34 
 
 
391 aa  58.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.98 
 
 
466 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.02 
 
 
466 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  33.8 
 
 
1834 aa  57  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  29.49 
 
 
384 aa  57.4  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.83 
 
 
435 aa  57  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  27.42 
 
 
359 aa  57  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>