94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00490 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00490  regulator of pathogenicity factors  100 
 
 		 425 aa  878    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2033  Carbohydrate-selective porin OprB  70.77 
 
 		 417 aa  604  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01615  regulator of pathogenicity factors  53.51 
 
 		 440 aa  474  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00130056  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1190  Carbohydrate-selective porin OprB  50.26 
 
 		 501 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1331  carbohydrate-selective porin OprB  44.47 
 
 		 510 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901069  hitchhiker  0.00588319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4576  carbohydrate-selective porin OprB  33.91 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2950  glucose-sensitive porin  32.67 
 
 		 452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.393124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1943  outer membrane porin OprB precursor  31.78 
 
 		 454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4276  carbohydrate-selective porin OprB  33.25 
 
 		 444 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.308576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34960  glucose-sensitive porin  32.26 
 
 		 452 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000209451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23030  glucose/carbohydrate outer membrane porin OprB precursor  32.18 
 
 		 454 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0211738 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1445  porin B  33 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.374886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4360  carbohydrate-selective porin OprB  33 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.081551  normal  0.195321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4205  carbohydrate-selective porin OprB  31.76 
 
 		 447 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1082  carbohydrate-selective porin OprB  32.01 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0774059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1019  porin B  31.59 
 
 		 447 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1017  carbohydrate-selective porin OprB  31.59 
 
 		 447 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.134295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1057  carbohydrate-selective porin OprB  31.59 
 
 		 447 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177917  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1632  putative porin B precursor outer (glucose porin) transmembrane protein  32.66 
 
 		 456 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1117  carbohydrate-selective porin OprB  30.1 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00415727  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3835  Carbohydrate-selective porin OprB  32.66 
 
 		 456 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.899229 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4912  Carbohydrate-selective porin OprB  32.66 
 
 		 456 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00363735  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1296  porin B  29.6 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329329  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1115  Carbohydrate-selective porin OprB  29.06 
 
 		 476 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.967056  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4366  carbohydrate-selective porin OprB  28.04 
 
 		 448 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00370105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2351  carbohydrate-selective porin OprB  28.39 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.348926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3570  carbohydrate-selective porin OprB  28.14 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2711  carbohydrate-selective porin OprB  27.86 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.695739  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2204  carbohydrate-selective porin OprB  27.92 
 
 		 422 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2957  carbohydrate-selective porin OprB  28.14 
 
 		 422 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1735  carbohydrate-selective porin OprB  28.64 
 
 		 449 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0819299 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4200  Carbohydrate-selective porin OprB  28.16 
 
 		 482 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5436  carbohydrate-selective porin, OprB family  28.06 
 
 		 446 aa  123  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390026  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2998  Carbohydrate-selective porin OprB  25.44 
 
 		 534 aa  122  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2894  Carbohydrate-selective porin OprB  25.94 
 
 		 509 aa  121  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1247  Carbohydrate-selective porin OprB  28.43 
 
 		 512 aa  120  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2771  carbohydrate-selective porin OprB  25.19 
 
 		 534 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0997  hypothetical protein  25.26 
 
 		 452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2969  carbohydrate-selective porin OprB  26.97 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10870  hypothetical protein  24.35 
 
 		 434 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00009778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4227  carbohydrate-selective porin OprB  25.36 
 
 		 498 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796044  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3070  carbohydrate-selective porin OprB  25.14 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.681986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2838  carbohydrate-selective porin OprB  25.14 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2860  carbohydrate-selective porin OprB  24.86 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00385913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4737  Carbohydrate-selective porin OprB  25.3 
 
 		 502 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0100904  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0854  Carbohydrate-selective porin OprB  25.2 
 
 		 485 aa  104  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.648225 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1832  carbohydrate porin  24.51 
 
 		 474 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.378247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1290  Carbohydrate-selective porin OprB  26.28 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3564  Carbohydrate-selective porin OprB  26.28 
 
 		 486 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2869  Carbohydrate-selective porin OprB  24.41 
 
 		 490 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.206481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4831  Carbohydrate-selective porin OprB  23.34 
 
 		 507 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0156749  normal  0.100608 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4004  carbohydrate-selective porin OprB  23.93 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3373  carbohydrate-selective porin OprB  25 
 
 		 486 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.389462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3682  Carbohydrate-selective porin OprB  24.74 
 
 		 486 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1274  carbohydrate-selective porin OprB  24.74 
 
 		 494 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1436  Carbohydrate-selective porin OprB  24.74 
 
 		 481 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1821  Carbohydrate-selective porin OprB  24.7 
 
 		 486 aa  89.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3354  carbohydrate porin  24.94 
 
 		 504 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3023  carbohydrate porin  24.94 
 
 		 504 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2070  carbohydrate porin  24.94 
 
 		 504 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0296  carbohydrate porin  24.94 
 
 		 504 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0309  carbohydrate porin  24.94 
 
 		 504 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2652  carbohydrate porin  24.94 
 
 		 504 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.486905  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1384  carbohydrate-selective porin OprB  24.94 
 
 		 490 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1659  Carbohydrate-selective porin OprB  24.94 
 
 		 490 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0489  carbohydrate porin  24.94 
 
 		 504 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0904  Carbohydrate-selective porin OprB  24.01 
 
 		 481 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0673705 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3953  carbohydrate-selective porin OprB  22.58 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268403  normal  0.112791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1380  Carbohydrate-selective porin OprB  24.41 
 
 		 522 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.768391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0267  carbohydrate porin  24.63 
 
 		 514 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0870  carbohydrate-selective porin OprB  27.05 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  hitchhiker  0.00100235 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2528  Carbohydrate-selective porin OprB  20.78 
 
 		 502 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.310329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1762  Carbohydrate-selective porin OprB  24.88 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4863  carbohydrate-selective porin OprB  24.36 
 
 		 514 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3503  carbohydrate-selective porin OprB  24.36 
 
 		 514 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488626  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5422  carbohydrate-selective porin OprB  24.62 
 
 		 493 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585602  normal  0.389505 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4759  carbohydrate-selective porin OprB  23.53 
 
 		 494 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.15964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4236  carbohydrate-selective porin OprB  24.11 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.269576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3053  hypothetical protein  27.63 
 
 		 253 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0310931  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0852  carbohydrate-selective porin OprB  23.27 
 
 		 495 aa  67  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1063  Carbohydrate-selective porin OprB  23.26 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.659002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3797  Carbohydrate-selective porin OprB  22.76 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5528  Carbohydrate-selective porin OprB  23.97 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703948  hitchhiker  0.0000405618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3489  carbohydrate-selective porin OprB  22.51 
 
 		 493 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3871  Carbohydrate-selective porin OprB  21.99 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0231495 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19511  hypothetical protein  21.51 
 
 		 452 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5314  Carbohydrate-selective porin  27.67 
 
 		 459 aa  55.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385247  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2023  Carbohydrate-selective porin protein  24.75 
 
 		 477 aa  55.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0980968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1477  Carbohydrate-selective porin OprB  30 
 
 		 462 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1366  Carbohydrate-selective porin OprB  23.21 
 
 		 461 aa  50.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1095  Carbohydrate-selective porin OprB  28.29 
 
 		 464 aa  50.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0806614  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7680  porin B  25.62 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00131365  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2156  carbohydrate-selective porin OprB  20.3 
 
 		 478 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1597  carbohydrate-selective porin OprB  33.75 
 
 		 480 aa  46.6  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0966255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>