More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00488 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 318 aa  632  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  68.14 
 
 		 318 aa  395  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2664  1-phosphofructokinase  56.55 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.877221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  56.93 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  54.44 
 
 		 315 aa  255  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1787  1-phosphofructokinase  57.14 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  50.69 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  56.77 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0611  1-phosphofructokinase  56.02 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  46.03 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  47.92 
 
 		 318 aa  228  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  45.16 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  47.54 
 
 		 326 aa  212  5.999999999999999e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  42.54 
 
 		 330 aa  196  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0907  1-phosphofructokinase  42.07 
 
 		 349 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  42.42 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  38.87 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  41.29 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  37.63 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  39.93 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  39.58 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  39.48 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  35.76 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  41.35 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  39.58 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  40.44 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  37.7 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  38.75 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  40.99 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  42.01 
 
 		 315 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  39.34 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  40.6 
 
 		 315 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  35.04 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  39.34 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  39.34 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  38.38 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  38.38 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  38.38 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  38.38 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  32.05 
 
 		 310 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  38.38 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  38.6 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  38.6 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  38.6 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  38.6 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  38.6 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  38.6 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  38.6 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  38.24 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  36.12 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  38.6 
 
 		 312 aa  159  8e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  39.33 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  37.27 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  41.35 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  35.45 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  36.12 
 
 		 323 aa  155  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  39.18 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  31.09 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  31.83 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  37.06 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4251  ribokinase-like domain-containing protein  40.69 
 
 		 331 aa  149  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.598338  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  31.44 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  36.84 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  31.89 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  34.4 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  33.57 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  31.06 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  32.14 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  36.46 
 
 		 315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  31.69 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  31.89 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  37.1 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  38.24 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  35.08 
 
 		 350 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  38.2 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  33.76 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  32.58 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  39.18 
 
 		 322 aa  135  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  39 
 
 		 315 aa  135  9e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1061  6-phosphofructokinase  37.31 
 
 		 473 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  33.96 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0117  6-phosphofructokinase  36.94 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425827  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  32.43 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  34.82 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1282  6-phosphofructokinase  36.94 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2801  6-phosphofructokinase  36.94 
 
 		 442 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  33.33 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  36.94 
 
 		 442 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0142  6-phosphofructokinase  36.94 
 
 		 449 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  32.3 
 
 		 324 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  32.52 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  35.47 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  36.55 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  37.55 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  32.89 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  32.89 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  32.89 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  32.89 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  36.43 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D04  tagatose-6-phosphate kinase  34.29 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0175284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>