More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00418 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  67.76 
 
 
628 aa  733    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  66.91 
 
 
549 aa  730    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  66.43 
 
 
600 aa  733    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  100 
 
 
556 aa  1121    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  37.37 
 
 
301 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  37.59 
 
 
283 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  37.33 
 
 
284 aa  170  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  36.86 
 
 
286 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  36.64 
 
 
292 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  37.46 
 
 
338 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  36.36 
 
 
292 aa  158  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  35.81 
 
 
293 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  37.11 
 
 
291 aa  157  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  37.18 
 
 
292 aa  156  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  33.12 
 
 
413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  35.84 
 
 
287 aa  151  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  32.99 
 
 
303 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  33.33 
 
 
288 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  35.14 
 
 
654 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  34.55 
 
 
246 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  34.06 
 
 
616 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  37.8 
 
 
535 aa  147  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  34.06 
 
 
657 aa  147  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  32.88 
 
 
282 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  36.7 
 
 
523 aa  145  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  35.64 
 
 
491 aa  145  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  36.79 
 
 
289 aa  141  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  32.76 
 
 
586 aa  140  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  35.05 
 
 
570 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  34.77 
 
 
751 aa  137  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  34.4 
 
 
551 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1278  hypothetical protein  35.03 
 
 
291 aa  134  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.633716  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  32.85 
 
 
698 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  35.02 
 
 
611 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  33.33 
 
 
826 aa  130  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  32.62 
 
 
1911 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  33.82 
 
 
781 aa  128  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
319 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  32.58 
 
 
522 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  32.87 
 
 
277 aa  127  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  35.09 
 
 
390 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  32.19 
 
 
892 aa  126  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  32.2 
 
 
1196 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  32.55 
 
 
269 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  32.28 
 
 
829 aa  124  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  33.99 
 
 
925 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  32.85 
 
 
281 aa  125  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  32.63 
 
 
517 aa  124  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  32.86 
 
 
433 aa  123  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  32.62 
 
 
325 aa  123  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  37.36 
 
 
348 aa  123  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  34.22 
 
 
882 aa  123  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  36.98 
 
 
348 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  29.58 
 
 
605 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  34.04 
 
 
586 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  30.94 
 
 
497 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  34.06 
 
 
616 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0221  protein of unknown function DUF323  29.86 
 
 
293 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.411087  normal  0.267436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  32.99 
 
 
1132 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
617 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0718  protein of unknown function DUF323  32.06 
 
 
298 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  32.61 
 
 
636 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  32.19 
 
 
603 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  31.9 
 
 
517 aa  117  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  33.68 
 
 
740 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  32.85 
 
 
742 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  30.92 
 
 
639 aa  117  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  30.92 
 
 
639 aa  117  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  29.62 
 
 
416 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  35.15 
 
 
319 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  31.72 
 
 
621 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  31.65 
 
 
527 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  29.25 
 
 
1104 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
293 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  26.92 
 
 
624 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.22 
 
 
820 aa  114  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  32.07 
 
 
593 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  32.73 
 
 
358 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  31.51 
 
 
618 aa  111  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 
349 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  30.42 
 
 
802 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  29.39 
 
 
292 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  29.39 
 
 
292 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  32.39 
 
 
877 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  32.13 
 
 
267 aa  109  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  29.1 
 
 
401 aa  110  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  30.94 
 
 
587 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 
620 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  29.19 
 
 
359 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  31.58 
 
 
305 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  33.45 
 
 
862 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  30.91 
 
 
538 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
308 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  29.39 
 
 
654 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  29.5 
 
 
267 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 
625 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  30.07 
 
 
346 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  30.62 
 
 
312 aa  104  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  32.49 
 
 
351 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 
303 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>