More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00395 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00395  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
186 aa  370  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  61.58 
 
 
187 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  53.7 
 
 
184 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
170 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  51.97 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
199 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
179 aa  161  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
179 aa  160  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
179 aa  160  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  55.48 
 
 
176 aa  159  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  50.63 
 
 
181 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
181 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  50.63 
 
 
181 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  55.26 
 
 
170 aa  159  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  50.63 
 
 
181 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  48.3 
 
 
177 aa  158  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 
181 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  54.61 
 
 
170 aa  158  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
174 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
172 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  54.19 
 
 
171 aa  156  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 
168 aa  156  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
172 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  48.19 
 
 
179 aa  155  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
180 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
181 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
181 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
172 aa  154  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  50.97 
 
 
171 aa  154  9e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
181 aa  153  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
178 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1169  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
182 aa  154  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0215372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  51.97 
 
 
172 aa  153  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
181 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  47.27 
 
 
171 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
172 aa  152  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
180 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
179 aa  151  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
185 aa  152  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  48.19 
 
 
181 aa  152  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
178 aa  151  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
171 aa  151  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1044  adenine phosphoribosyltransferase  43.86 
 
 
182 aa  151  5.9999999999999996e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
174 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 
185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  50.97 
 
 
172 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  50.97 
 
 
172 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  50.66 
 
 
173 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
178 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
179 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
180 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
171 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  48.19 
 
 
175 aa  150  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  48.17 
 
 
187 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
178 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
171 aa  149  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
182 aa  149  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  50.97 
 
 
170 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  47.27 
 
 
193 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
170 aa  149  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  49.06 
 
 
172 aa  148  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1608  adenine phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
182 aa  147  7e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000613575  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  48.73 
 
 
173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  51.97 
 
 
171 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  49.36 
 
 
170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  46.39 
 
 
186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  48.68 
 
 
171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  43.11 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  50.67 
 
 
175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2115  adenine phosphoribosyltransferase  54.49 
 
 
175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00527883  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0680  adenine phosphoribosyltransferase  45.62 
 
 
179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  47.5 
 
 
177 aa  145  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
177 aa  145  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14000  adenine phosphoribosyltransferase  50.91 
 
 
183 aa  145  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  48.19 
 
 
175 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  47.31 
 
 
172 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1118  adenine phosphoribosyltransferase  48.41 
 
 
182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00971568  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0840  adenine phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  45.57 
 
 
183 aa  145  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  52.9 
 
 
172 aa  144  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
172 aa  144  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 
181 aa  144  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  45.57 
 
 
183 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  45.57 
 
 
183 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  45.57 
 
 
183 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  47.31 
 
 
172 aa  144  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  45.57 
 
 
183 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  48.75 
 
 
170 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  45.57 
 
 
183 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  45.57 
 
 
183 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  45.57 
 
 
183 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  45.57 
 
 
183 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  48.7 
 
 
171 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0827  adenine phosphoribosyltransferase  44.65 
 
 
175 aa  142  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010482  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  44.3 
 
 
183 aa  142  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1315  adenine phosphoribosyltransferase  45.68 
 
 
182 aa  141  4e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000201282  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
173 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>