More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00256 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  100 
 
 		 645 aa  1327    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  41.07 
 
 		 741 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  40.76 
 
 		 741 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  39.84 
 
 		 741 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  41.33 
 
 		 646 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  40.68 
 
 		 643 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  39.81 
 
 		 689 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  40.48 
 
 		 689 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  37.23 
 
 		 734 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  37.31 
 
 		 731 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  37.23 
 
 		 734 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  35.86 
 
 		 683 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  37.23 
 
 		 734 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  37.23 
 
 		 734 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  37.23 
 
 		 734 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  37.23 
 
 		 734 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  36.02 
 
 		 683 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  36.97 
 
 		 731 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  35.1 
 
 		 618 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  37.72 
 
 		 757 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  35.43 
 
 		 645 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  35.1 
 
 		 619 aa  375  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  36.53 
 
 		 734 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  36.2 
 
 		 734 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  34.79 
 
 		 735 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  34.14 
 
 		 712 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  34.92 
 
 		 907 aa  365  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 769 aa  365  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  37.09 
 
 		 794 aa  365  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  36.93 
 
 		 756 aa  364  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  37.11 
 
 		 572 aa  364  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  37.37 
 
 		 730 aa  363  5.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  35.14 
 
 		 771 aa  362  9e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  36.93 
 
 		 780 aa  361  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  36.58 
 
 		 778 aa  360  6e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  32.24 
 
 		 753 aa  360  6e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  36.31 
 
 		 767 aa  359  7e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  36.31 
 
 		 767 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  35.99 
 
 		 788 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  36.82 
 
 		 755 aa  358  2.9999999999999997e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  35.99 
 
 		 774 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  36.1 
 
 		 748 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  38 
 
 		 796 aa  357  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  36.05 
 
 		 792 aa  354  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  39.33 
 
 		 841 aa  351  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  39.33 
 
 		 841 aa  351  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  39.33 
 
 		 838 aa  350  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  38.55 
 
 		 841 aa  348  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  37.48 
 
 		 785 aa  343  5e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3043  type VI secretion system Vgr family protein  37.65 
 
 		 611 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313865  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  33.92 
 
 		 777 aa  338  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  33.94 
 
 		 687 aa  331  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  34.73 
 
 		 730 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  31.83 
 
 		 692 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  35.43 
 
 		 729 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  31.77 
 
 		 692 aa  325  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  35.25 
 
 		 729 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  35.15 
 
 		 642 aa  324  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  35.21 
 
 		 714 aa  323  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  32.94 
 
 		 1048 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  33.84 
 
 		 743 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  32.34 
 
 		 724 aa  319  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  36.94 
 
 		 901 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  34.5 
 
 		 680 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  32.54 
 
 		 613 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  32.2 
 
 		 1057 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  36.77 
 
 		 975 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  31.18 
 
 		 754 aa  313  9e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  33.75 
 
 		 680 aa  312  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  34.79 
 
 		 616 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  34.51 
 
 		 783 aa  310  6.999999999999999e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  32.06 
 
 		 872 aa  309  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  31.21 
 
 		 703 aa  310  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  33.28 
 
 		 741 aa  309  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  32.21 
 
 		 858 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  32.21 
 
 		 896 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  32.21 
 
 		 930 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  33.28 
 
 		 741 aa  309  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  33.01 
 
 		 669 aa  308  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  34.47 
 
 		 688 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  33.87 
 
 		 678 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  34.86 
 
 		 668 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  32.67 
 
 		 641 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  34.06 
 
 		 680 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  33.57 
 
 		 763 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  33.57 
 
 		 763 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  33.73 
 
 		 668 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  35.09 
 
 		 661 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  32.93 
 
 		 661 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  32.78 
 
 		 661 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  33.57 
 
 		 763 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  35.02 
 
 		 661 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  35.02 
 
 		 661 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  35.02 
 
 		 661 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  35.02 
 
 		 661 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  35.02 
 
 		 661 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  34.31 
 
 		 808 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  33.91 
 
 		 680 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  36.38 
 
 		 676 aa  302  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  33 
 
 		 709 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>